PURIFICACION DE MDMV
Adaptado por: Fulgencio Espejel Carrasco por W. Lamgenberg Plant Virology, Protocols Volumen 81, Foster y Taylor Complementado por Susana Ruiz 15/04/08
Este método fue desarrollado originalmente por W. Lamgenberg, quien reportó que la adición de HCL guanidina 2M en las etapas 16 aumenta significativamente la producción de virus. Preparar los reactivos un día antes!! BUFFERS PARA LA PURIFICACION DE MDMV o SCMV __1. Buffer A: Citrato de amonio 0.1 M, dibásico, a pH 6,0 ajustado con KOH sólido. Preparar una solución stock 1.0 M. __2. Buffer B: Es Buffer A conteniendo 1% de Polivinyl pirrolidona (PM 40,000) y 0,5% 2-ß-mercaptoetanol (Buffer de molienda) __3. Buffer C: Buffer A conteniendo 0.5% de 2- ß-mercaptoetanol __4. Buffer D: Buffer C conteniendo 20% (w/v) sacarosa __5. Buffer E: Buffer A conteniendo 10, 20, 30 y 40% de sacarosa (w/v) para la preparación del gradiente de sacarosa. Procedimiento: 1.- Colectar 1500 g de tejido infectado y moler en una licuadora grande preenfriada y con un mínimo de 1 – 1.5 volúmenes (p/v con respecto al tejido inicial) de buffer B _____. Tamizar el contenido a través de diversas capas de gasa, exprimiendo la savia hasta donde sea posible en un vaso de vaso de precipitado de 2 litros. 2.- Adicionar tetracloruro de carbono al 5% (v/v) ______y mezclar por 5 s (hacerlo en campana de extracción) y repartir la savia en cuatro botellas de centrífuga de 500 ml cada uno (poner en hielo) 3.- Centrifugar a 7000 rpm por 10 min a 4°C usando el rotor JA10. 4.- Recuperar con cuidado el sobrenadante (cuidando de no llevarse el tetracloruro de carbono!, de preferencia usar lana de vidrio estéril y un embudo) y ponerlo en otro vaso de vaso de precipitado de 2 litros para adicionarle Triton X-100 a una concentración final de 0.25% ______ y adicionar PEG sólido a una concentración final de 6%______. Agitar hasta disolver (alrededor de 1 h) hacerlo en el cuarto frío. Repartir el sobrenadante en botellas de centrífuga de 500 ml. 5.- Centrifugar la solución por 20 min. a 10000 – 15000g (7000 rpm en JA14) a 4ºC, descartar el sobrenadante. Resuspender la pastilla en aprox 1/10 volúmenes de buffer C ____ (con respecto al buffer B utilizado en el punto 1) y clarificar por centrifugación 10 min. a 8000 rpm. GUARDAR EL SOBRENADANTE. 6.- En un tubo Beckman ultra claro de 35 ml 25x89mm (ubicado en el cajón #10), agregar 8 ml del buffer D y 25 ml del sobrenadante y centrifugar por 90 min. a 100 000 g ( 27000 rpm usando el rotor SW 28 ) a 4°C. (pesar las fundas del rotor SW28 y equilibrarlas con el peso del tubo con el buffer D y sobrenadante igualando sus pesos). Resuspender las pastillas en aproximadamente 1/5 del volumen anterior ____ ml de buffer A (dependerá de la cantidad de tubos que uno guste procesar) y pasarla a tubos eppendorf para centrifugar a 12 000 rpm por 10 min a 4°C.
7.- En otro tubo Beckman ultra claro (ubicado en el cajon #10) de 5.0 ml (13x51mm) agregar el gradiente de densidad de sacarosa del 10- 40% (buffer E) y posteriormente el sobrenadante, Centrifugar por dos horas a 100 000 g. ( 27000 rpm usando el rotor SW55Ti )
8,- Fraccionar la columna centrifugada tomando muestras desde la parte superior hasta la inferior de 500 µl en cada fracción y colectar la fracción de alta abs leídas a longitud de onda de 254 nm. 9.- Dializar la fracción que contiene al virus toda la noche contra diversos cambios de buffer A o simplemente diluir la fracción y centrifugar a alta velocidad para concentrar el virus.