Ebm Pico.docx

CRITICAL APPRAISAL EVIDENCE-BASED MEDICINE BLOK KEDOKTERAN KELUARGA

AKHDAN AUFA 1102013018

Dosen Pembimbing: DR dr.Fatimah Eliana, Sp.PD-KEMD

FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS YARSI JAKARTA 2016

1. SKENARIO Seorang laki-laki berumur 45 tahun datang ke puskesmas dengan keluhan batuk berdahak bercampur darah dan rasa nyeri di dada. Pada pemeriksaan didapatkan ronki basah halus nyaring pada apeks paru kanan. Dokter menduga pasien terkena Tuberkulosis Paru. Dokter memberikan pilihan kepada pasien antara pemeriksaan Ziehl-NeelSeen atau GeneXpert demi memastikan diagnosis. 2. PERTANYAAN Apakah pemeriksaan GeneXpert lebih efektif dalam menegakkan diagnosis Tuberkulosis Paru dari pada pemeriksaan Ziehl-NeelSeen ? 3. KOMPONEN PICO P : Pasien laki-laki dengan dugaan Tuberkulosis Paru I : Pemeriksaan Ziehl-NeelSeen C: GeneXpert pada dahak O: GeneXpert lebih efektif dari Pemeriksaan Ziehl-Neelseen

4. KATA KUNCI Tuberculosis AND Ziehl-NeelSeen AND GeneXpert

5. PEMILIHAN SITUS https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

6. LIMITATION 5 tahun terakhir

7. HASIL PENCARIAN (10) 

Evaluation of the GeneXpert MTB/RIF assay on extrapulmonary and respiratory samples other than sputum: a low burden country experience. Pandey S, Congdon J, McInnes B, Pop A, Coulter C.

Pathology. 2016 Nov 29. pii: S0031-3025(16)40285-0. doi: 10.1016/j.pathol.2016.10.004. [Epub ahead of print] PMID: 27913043



Comparison of a real-time polymerase chain reaction-based system and Erlich-Ziehl-Neelsen method with culture in the identification of Mycobacterium tuberculosis. Bilgin K, Yanik K, Karadağ A, Odabaşi H, Taş H, Günaydin M. Turk J Med Sci. 2016 Jan 5;46(1):203-6. doi: 10.3906/sag-141134. PMID: 27511355



Comparative Study of GeneXpert with ZN Stain and Culture in Samples of Suspected Pulmonary Tuberculosis. Agrawal M, Bajaj A, Bhatia V, Dutt S. J Clin Diagn Res. 2016 May;10(5):DC09-12. doi: 10.7860/JCDR/2016/18837.7755. PMID: 27437212



Genotyping of mutations detected with GeneXpert. N'guessan Kouassi K, Riccardo A, Dutoziet Christian C, André G, Férilaha C, Hortense SA, Jean-Marc A, Daniela Maria C, Mireille D. Int J Mycobacteriol. 2016 Jun;5(2):142-7. doi: 10.1016/j.ijmyco.2016.01.001. PMID: 27242224



Comparative Yield of Different Diagnostic Tests for Tuberculosis among People Living with HIV in Western Kenya. Cavanaugh JS, Modi S, Musau S, McCarthy K, Alexander H, Burmen B, Heilig CM, Shiraishi RW, Cain K. PLoS One. 2016 Mar 29;11(3):e0152364. doi: 10.1371/journal.pone.0152364. PMID: 27023213



Diagnosis of lymph node tuberculosis using the GeneXpert MTB/RIF in Tunisia. Ghariani A, Jaouadi T, Smaoui S, Mehiri E, Marouane C, Kammoun S, Essalah L, Driss M, Messadi F, Slim-Saidi L. Int J Mycobacteriol. 2015 Dec;4(4):270-5. doi: 10.1016/j.ijmyco.2015.05.011. PMID: 26964807



Evaluation of molecular detection of extrapulmonary tuberculosis and resistance to rifampicin with GeneXpert® MTB/RIF. Marouane C, Smaoui S, Kammoun S, Slim L, Messadi-Akrout F. Med Mal Infect. 2016 Feb;46(1):20-4. doi: 10.1016/j.medmal.2015.10.012. PMID: 26654321



Rapid diagnosis of tuberculosis using Xpert MTB/RIF assay Report from a developing country. Iram S, Zeenat A, Hussain S, Wasim Yusuf N, Aslam M. Pak J Med Sci. 2015 Jan-Feb;31(1):105-10. doi: 10.12669/pjms.311.6970. PMID: 25878624



GeneXpert MTB/RIF Testing in the Management of Patients with Active Tuberculosis; A Real Life Experience from Saudi Arabia. Omrani AS, Al-Otaibi MF, Al-Ateah SM, Al-Onazi FM, Baig K, El-Khizzi NA, Albarrak AM. Infect Chemother. 2014 Mar;46(1):30-4. doi: 10.3947/ic.2014.46.1.30. PMID: 24693467



Evaluation of GeneXpert MTB/RIF for diagnosis of tuberculous meningitis. Nhu NT, Heemskerk D, Thu do DA, Chau TT, Mai NT, Nghia HD, Loc PP, Ha DT, Merson L, Thinh TT, Day J, Chau Nv, Wolbers M, Farrar J, Caws M.

J Clin Microbiol. 2014 Jan;52(1):226-33. doi: 10.1128/JCM.0183413. PMID: 24197880

8. ARTIKEL DIPILIH Comparative Study of GeneXpert with ZN Stain and Culture in Samples of Suspected Pulmonary Tuberculosis. Agrawal M, Bajaj A, Bhatia V, Dutt S. J Clin Diagn Res. 2016 May;10(5):DC09-12. doi: 10.7860/JCDR/2016/18837.7755.

I.

Apakah hasil penelitian valid? 

Petunjuk Primer o Apakah terdapat perbandingan yang independen dan blind terhadap suatu standar rujukan? Ya, terdapat perbandingan antara Pemeriksaan GeneXpert dan Pemeriksaan ZN.

o Apakah sampel pasien mencakup spektrum penderita yang sesuai dengan setting praktek klinis dimana uji diagnostik tersebut akan diaplikasikan? Ya mencakup, pada penelitian ini pasien yang diperiksa berdasarkan kriteria inklusi atau eksklusi

Petunjuk Sekunder o Apakah hasil tes yang sedang dievaluasi mempengaruhi keputusan untuk menjalankan standar rujukan? Ya, penggunaan GeneXpert lebih efektif daripada Ziehl NeeSeen

o Apakah metode untuk melaksanakan tes tersebut dideskripsikan cukup rinci untuk dapat dilakukan replikasi? Ya dideskripsikan, tatacara penggunaan GeneXpert dan Ziehl Neeseen

II. Apakah hasilnya? 

Apakah likelihood rasio hasil tes atau data yang dibutuhkan untuk penghitungannya ditampilkan? Ya, pada jurnal ini data yang dibutuhkan untuk penghitungannya ditampilkan

Zn Stain 

BAL -

Sensitivitas

: 22,2 %

-

Spesifisitas

: 100 %

Likelihood Ratio: 

LR positif

=

sensitivitas : (1-spesifisitas)

= 0,222 : (1-1)

=

(1-sensitivitas) : spesifisitas

= (1-0,222) : 1

=0 

LR negative = 0,78



Sputum -

Sensitivitas

: 72,2 %

-

Spesifisitas

: 100 %

Likelihood Ratio: 

LR positif

=

sensitivitas : (1-spesifisitas)

= 0,722 : (1-1)

=

(1-sensitivitas) : spesifisitas

= (1-0,722) : 1

=

sensitivitas : (1-spesifisitas)

= 0,814 : (1-

=

(1-sensitivitas) : spesifisitas

= (1-0,814) :

=0 

LR negative = 0,28

GeneXpert 

BAL -

Sensitivitas

: 81,4%

-

Spesifisitas

: 93,4%

Likelihood Ratio: 

LR positif 0,934) = 12,33



LR negative 0,934 = 0,20



Sputum -

Sensitivitas

: 100 %

-

Spesifisitas

: 90 %

Likelihood Ratio: 

LR positif

=

sensitivitas : (1-spesifisitas)

= 1 : (1-0,90) =

=

(1-sensitivitas) : spesifisitas

= (1-1) : 0,90 =

10 

LR negative 0,90

III.

Apakah hasil penelitian tersebut membantu dalam tatalaksana pasien saya? 

Apakah reprodusibilitas hasil tes dan interpretasinya sesuai pada setting saya?

Ya, sesuai hasil tes dapat membantu menegakkan diagnosis Tuberkulosis Paru menggunakan BAL dan Sputum sebagai specimen 

Apakah hasilnya dapat diaplikasikan untuk pasien saya?

Ya dapat, penggunaan GeneXpert dengan spesimen Sputum lebih efektif dengan Likelihood Ratio Positif 10 dan Negatifnya 0,90 dibandingkan Zn Stain dengan spesimen sputum dengan Likelihood Ratio Positif 0 dan Negatif 0,28. Dengan hasil tersebut penggunaan GeneXpert memiliki kemungkinan 10 kali lebih tinggi untuk memiliki hasil tes positif pada orang yang sakit, daripada penggunaan Zn Stain 

Apakah hasil tersebut akan mengubah tatalaksana saya?

Pada Jurnal ini tidak dijelaskan, dikarenakan hanya membandingkan sensitivitas,spesifisitas, NPV dan PPV.



Akankah pasien menjadi lebih baik dengan aplikasi hasil tes tersebut?

Ya, pasien menjadi lebih cepat dan lebih akurat dalam mendapatkan diagnosis terhadap penyakitnya jika menggunakan GeneXpert daripada penggunaan pemeriksaan Ziehl-Neelsen