Picornaviridae.ppt

Picornaviridae Virology

Keluarga virus Strand RNA

PICORNAVIRIDAE • Lebih dari 200 virus tersebar luas di seluruh dunia. • menyebabkan banyak penyakit serius pada hewan dan manusia. • Virus hewan pertama dan virus mulut (1898). • Poliovirus adalah contoh penting:

- Virus pertama dimurnikan dan dikristalisasi. - Vaksin inaktif pertama yang digunakan (Salk 1950-an).

PicoRNAvirus RNA indera positif, kapsid , 25-30nm, dan tanpa amplop

Pico = kecil Positive sense ICOsahedral Genom RNA 4 lapisan protein VP1, VP2, VP3, VP4 capsid sederhana: 60 kapsomer (terdiri dari VP1, 2,3) Genom untai tunggal dari 7500-8500 nukleotida

• Picornavirus adalah salah satu patogen vertebrata terkecil dan bertanggung jawab atas banyak penyakit penting pada manusia dan hewan • Picornavirus bertanggung jawab atas berbagai penyakit klinis yang dihasilkan dari berbagai faktor seperti spesifisitas reseptor, kerentanan spesifik jaringan, virulensi dan mekanisme penularan. • Picornavirus mengikat reseptor permukaan sel khusus dan interaksi ini merupakan faktor penting dalam menentukan host dan spesifisitas jaringan masing-masing virus.

4

Properties  mereplikasi dalam sitoplasma  mengkodekan polimerase  protein virus matang dihasilkan melalui pembelahan proteolitik

• Picornavirus tidak dapat masuk ke sel melalui fusi membran, seperti halnya virus yang diselimuti, dan memerlukan mekanisme khusus untuk menembus membran seluler dan secara aman mengirimkan genom ke dalam sel inang. • Replikasi genom terjadi dalam membran seluler yang dimodifikasi oleh virus • Viral RNA membentuk molekul-molekul untai negatif komplementer yang pada gilirannya membentuk banyak salinan untai positif.

• Mekanisme penularan infeksi memainkan peran penting dalam epidemiologi infeksi picornavirus

6

klasifikasi Genus

Penyakit

Enterovirus

Anggota tipe virus polio Virus Coxsackie A / B Enterovirus tipe 71 penyakit vesikular babi enterovirus babi

3 tipe utama menyebabkan kelumpuhan.

Rhinovirus

menyebabkan infeksi saluran pernapasan

menyebabkan pilek pada manusia (110 jenis) dan babi

Hepatovirus

Hepatitis A ensefalomielitis unggas

infeksi hati menular

Apthovirus

Penyakit kaki dan mulut

paling merusak di Afrika

Cardiovirus

virus ensefalomiokarditis ECMV Grup EMC

menyebabkan peradangan jantung dan otak sumber nya adalah reservoir hewan pengerat

Parechovirus

Human Parechovirus 1 & 2 (HPEV1 & HPEV2)

Erbovirus Koburirius Teschovirus

porchine teschovirus

7

Struktur virion

•

Virus icosahedral telanjang, berukuran 22-30 nm, dengan inti padat sekitar 16 nm. nilai sedimentasi adalah 160S • Kapsid terdiri dari susunan icosahedral yang padat berisi 60 protomer, masingmasing terdiri dari 4 polipeptida, VP1, VP2, VP3 dan VP4. • VP4 terletak di sisi internal kapsid. RNA adalah RNA untai tunggal ： 1. 35S, 2,4 X 106 dalton, 7-8 Kb, 30% dari massa virion 2. 3 'end 90 poly A nukleotida 3. 5 'tidak dibatasi tetapi diakhiri di pUp yang terhubung secara kovalen dengan 8 a 2 kD (VPg) protein bergabung melalui tautan ester ke tirosin

Genome

1. linear, ssRNA (+) genom 7,1-8,9 kb, polyadenylated, terdiri dari satu ORF tunggal yang mengkode poliprotein. 2. RNA genomik virus memiliki protein virus (VPg) pada ujung 5 'dan bukan struktur topi nukleotida teretilasi. 3. UTR panjang di ujung 5 'berisi situs entri ribosom internal (IRES). IRES memungkinkan terjemahan langsung polyprotein. 4. Wilayah P1 mengkodekan polipeptida struktura. 5. Wilayah P2 dan P3 mengkodekan protein non-struktural yang terkait dengan replikasi

6. 3 'UTR yang lebih pendek penting dalam sintesis untai (-). 7. L adalah protein pemimpin N-terminal tambahan yang hadir dalam beberapa genera yang dapat berupa protease (aphthovirus, erboviruses) atau memiliki fungsi lain (kobuvirus, 10 cardiovirus).

Cara masuk ke dalam Sel

• Beberapa virus yang tidak diselimuti menyuntikkan genomnya ke dalam sitoplasma inang melalui pembuatan pori di membran inang. Ini dimediasi oleh peptida pembentuk pori virus yang terkait dengan kapsid virus.

• Kapsul icosahedric dari picornaviridae mampu membuat pori baik di plasma atau membran endosom untuk menyuntikkan RNA genomik mereka. 11

Cara masuk ke dalam Sel • Selama interaksi virus polio dengan penataan ulang konformasi utama reseptornya terjadi dalam partikel virus.  Partikel kehilangan VP4 dan N-terminus hidrofobik dari VP1 dipindahkan ke permukaan virion  N-termini dari VP1 membentuk pori dalam membran sel di mana RNA dilepaskan ke dalam sitosol.  Beberapa bukti menunjukkan bahwa partikel virus dapat mengalami endositosis pada beberapa tipe sel.

12

Replikasi Picornavirus

13

RHINOVIRUS • Berasal dari bahasa Yunani rhin-, yang berarti "hidung“, adalah genus dari Picornavirus, family dari virus.

• Rhinovirus adalah virus yang paling sering menginfeksi manusia, yang menyebabkan flu.

14

Rhinovirus (RV) Menjadi penyebab utama dari terjadinya kasus-kasus flu (common cold) dengan presentase 3040%.

Common cold -> Infeksi saluran pernafasan akut (ISPA) bagian atas.

15

PATOGENITAS • Infeksi saluran pernapasan atas (mis. hidung, mulut) • Inkubasi singkat (2-3 hari) • IFN endogen membantu * Mencegah penyakit • igA yang disintesis secara lokal • igG serum bertahan selama bertahun-tahun

* lebih dari 100 rhinovirus * Tubuh tidak dapat mengenali rhinovirus baru

16

Gejala • Hidung berair • Bersin-bersin • sedikit / tidak demam

17

Pencegahan • Hidup bersih • Cuci tangan • jangan menyentuh mata / hidung

• Tutup bersin dengan tissu dan membuangnya

18

epidemiology • Terdapat di sepanjang tahun • beberapa serotipe beredar bersamaan • Virus lebih banyak masuk melalui hidung

19

Diagnosis Laboratorium • Metode yang paling umum: mengisolasi virus dari sampel tinja atau sampel tenggorokan dari mulut Jarang diisolasi dari CSF

• Identifikasi serotipe dengan uji netralisasi • Metode asam nukleat: sekuensing genom untuk menentukan apakah infeksi disebabkan oleh vaksin atau virus tipe liar.

20

21