El principal problema que hay en el rio bogotá es la contaminación desde su cabecera hasta el final, por el vertimiento de aguas residuales las cuales tienen diferentes cargas fisicas, quimicas y biologicas. Según las pruebas realizadas en el laboratorio de la universidad ecci (sede p) se logro determinar que el agua tomada, tenia un gran contenido de sulfatos. Según Alfonso perez preciado 2010 “ El rio presenta contaminacion alta por los siguientes metales toxicos: CROMO: Especialmente en el sector de curtiembres de villapinzon y aguas debajo de la desmbocadura del rio tunjuelo, donde, tambien, hay una importante industria de curtiembres. PLOMO: Particularmente se encuentra en los tramos aguas debajo de los curtiembres de villapinzon y de la desmbocadura del tunjuelo.”
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