Proses yang dipilih dalam dekafeinasi ini adalah dengan metode swiss water. Jika dilihat dari 12 principle of green engineering metode ini dipil ih karena beberapa alasan, yaitu : 1. Karakteristik bahan kimia yang digunakan sangat aman dan ramah lingkungan, karena metode ini menggunakan air. Sehingga dapat memenuhi prinsip pertama dalam green engineering. 2. Metode ini dapat mencegah pabrik membuat limbah yang terlalu banyak dan berbahaya, karena bahan utama yang digunakan untuk membuat kopi rendah kafein hanya menggunakan kopi dan air. Sehingga limbah yang dihasilkan hanya merupakan kafein yang telah dipisahkan dan kotoran dari kopi setelah dibersihkan pertama kali. Alasan ini memenuhi prinsip kedua green engineering. 3. Desain pemisahan yang digunakan merupakan beberapa tangki perendaman dengan karbon aktif yang disusun secara berurutan dan energi yang diperlukan adalah energi panas untuk memanaskan air. Ini memenuhi prinsip ketiga dalam prinsip green engineering karena desain yang ramah lingkungan dan efisiansi energi. 4. Metode ini juga efisien terhadap energi, massa, dan waktu karena dalam waktu 8 – 10 jam akan didapatkan kopi bebas kafein sebanyak 99,9%. Sehingga ini dapat memenuhi prinsip ke empat green engineering. Dengan menggunakan alasan diatas dapat dijadikan dasar dalam memilih metode ini. Walaupun masih terdapat kekurangan dalam metode ini adalah konstruksi pabrik yang terlalu kompleks sehingga jenis bahan dan alat untuk membuat pabrik dengan metode ini akan sangat beragam dan membebani biaya perawatan. Jika dilihat dari 12 principle of green chemistry metode ini dipilih karena beberapa alasan, yaitu : 1. Material bahan yang merupakan air dapat diregenerasi dan bahan kopi dapat sepenuhnya menjadi produk akhir dengan limbah kafein yang ramah lingkungan. Dari alasan tersebut dapat memenuhi prinsip pertama dari green chemistry. 2. Swiss water methode merupakan metode yang sangat aman, tidak menghasilkan bahan berbahaya, tidak toksik bagi lingkungan, dan pelarut yang digunakan merupakan air mendidih. Sehingga ini dapat memenuhi prinsip ke tiga, empat, dan lima dari green chemistry.
3. Bahan dasar utama yaitu biji kopi dan air, dimana keduanya merupakan bahan yang ekonomis dan dapat diperbaharui. Ini memenuhi prinsip ke tujuh dalam green chemistry. 4. Metode ini juga dapat meminimalisir kecelakaan yang terjadi jika dibuat untuk skala pabrik, karena pabrik hanya membutuhkan panas yang tidak terlalu tinggi untuk memanaskan air dan tangki perendaman berada dalam kondisi tekanan yang sama pada tekanan udara luar. Dari desain tersebut akan memenuhi prinsip ke sepuluh dan kedua belas pada green chemistry. Dengan menggunakan alasan diatas dapat dijadikan dasar dalam memilih metode ini.