Genetika praskavca in stanje v Sloveniji Gregor Gorjanc in sod.
[email protected]
UL, Biotehniška fakulteta, Oddelek za zootehniko UL, Veterinarska fakulteta in Nacionalni veterinarski inštitut
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 1/17
Kazalo ■
TSE, BSE, . . .
■
Praskavec
■
Gen PrP
■
Ostali vplivi
■
Selekcija na odpornost
■
Stanje v Sloveniji
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 2/17
TSE, BSE, . . . ■
■
BSE, CJD, vCJD, praskavec, . . . –> TSE (Transmisivna Spongiformna Encefalopatija) prionske bolezni
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 3/17
ˇ Kopicenje prionov
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 4/17
TSE, BSE, . . . ■
■
BSE, CJD, vCJD, praskavec, . . . –> TSE (Transmisivna Spongiformna Encefalopatija) prionske bolezni ◆ prion = “proteinaceous” + “infectious” ◆ “povzroˇ citelj” protein?! ◆ odpornost prionov ◆ spreminjanje normalne oblike PrP v PrPSc ◆ dolga inkubacijska doba ◆ ni zdravila –> smrt ◆ prenos med vrstami ovce –> | cˇ lovek ovce –> ? govedo govedo –> ? cˇ lovek n n n
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 5/17
Praskavec ■ ■ ■
■
prvi zapisi v 1732 iz Velike Britanije razširitev? po vsem svetu Avstralija in Nova Zelandija prosti praskavca praskanje, motnje v obnašanju
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 6/17
Praskavec: primer
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 7/17
Praskavec ■ ■ ■
■ ■ ■ ■ ■
prvi zapisi v 1732 iz Velike Britanije razširitev? po vsem svetu Avstralija in Nova Zelandija prosti praskavca praskanje, motnje v obnašanju horizontalni in vertikalni (posteljica) prenos starost nastopa bolezni 2-5 let bolezen prisoten v cˇ redi še dolgo po izbruhu povzroˇcitelj še neznan
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 8/17
Gen PrP ■ ■
■
■
■ ■
Sip (scrapie incubation period) gen pri ovcah “knock-out” pri miših –> gen PrP polimorfizem na genu PrP povezan s PrP –> PrPSc ◆ kodon 136: alanin - A / valin - V ◆ kodon 154: arginin - R / histdin - H ◆ kodon 171: arginin - R / histdin - H / glutamin - Q razlike le na enem mestu kodona - tocˇ kovne mutacije alela A136 R154 R171 , genotip A136 R154 R171 /A136 R154 H171 verjetnost rekombinacij med 136. in 171. kodonom 0.000105%
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 9/17
Gen PrP: shema alel AHR AHQ
ARR
VRR
ARQ
ARH Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
VRQ - p. 10/17
Gen PrP: genotip in dovzetnost Gen PrP doloˇca dovzetnost za praskavec! Še vedno je potreben povzrocˇ itelj! Ali alela ARR daje odpornost?!
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 11/17
Gen PrP: NSP ■ ■
■
tudi druga polimorfna mesta (112, 137, 138, 141, . . . ) veliko število genotipov ◆ 5 alel –> 15 genotipov ◆ 6 alel –> 21 genotipov ◆ 7 alel –> 28 genotipov ◆ ... NSP (National Scrapie Plan) skupine ◆ 1 - ARR/ARR ◆ 2 - ARR/AHQ, ARR/ARH, ARR/ARQ ◆ 3 - AHQ/AHQ, AHQ, ARH, AHQ/ARQ, ARH/ARQ, ARH/ARH, ARQ/ARQ ◆ 4 - ARR/VRQ ◆ 5 - AHQ/VRQ, ARH/VRQ, ARQ/VRQ, VRQ/VRQ
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 12/17
Ostali vplivi ■
■
okoliški ◆ velikost gnezda ◆ naˇ cin vzreje jagnjet ◆ spol (ovce bolj dovzetne kot ovni) genetski ◆ QTL pri miših in ovcah ◆ poligena komponenta (21 % vse genetske variabilnosti)
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 13/17
Selekcija na odpornost ■
CILJ: dvig frekvence ARR
■
METODA: odbira živali iz posameznih NSP skupin
■
VPLIVI: ◆ frekvenca posameznih alel ◆
◆
velikost populacije –> parjenje v sorodstvu korelacija s proizvodnimi rezultati plodnost mleˇcnost rast n n n
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 14/17
Slovenija: stanje ■
direktive Evropske unije za monitoring
■
posnetek stanja frekvence alel za gen PrP ◆ ◆
◆
◆
nakljuˇcni vzorec po pasmah v Sloveniji od 2005 vsi ovni s preizkusnih postaj Logatec in Jezersko zajete pasme: jezersko-solˇcavska (JS), oplemenjena JS (JSR), bovška (B), istrska pramenka (IP), belokranjska pramenka (BP) in texel (T) skupaj 608 živali (467 ovnov in 141 ovc)
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 15/17
Slovenija: frekvence alel ■ ■
6 alel: ARR, AHQ, ARH, ARQ, VRQ in VRR 14 genotipov
Pasma N ARR AHQ ARH ARQ VRQ* JS 220 0.18 0.07 0.08 0.60 0.07 JSR 158 0.11 0.11 0.01 0.71 0.05 B 52 0.17 0.16 0.06 0.56 0.05 IP 87 0.25 0.08 0.01 0.60 0.06 BP 72 0.29 0.04 0.00 0.65 0.01 T 19 0.37 0.05 0.13 0.39 0.05 * - VRQ in VRR ■ ■
izloˇcevali bomo VRQ potrebne dodatne analize
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 16/17
Sklepi ■
praskavec spada v skupino prionskih bolezni
■
neznan povzroˇcitelj, znaz proces PrP –> PrPSc
■
gen PrP ima kljuˇcno vlogo; veliko nejasnosti in variabilnosti
■
odbira živali z alelami ARR
■
v Sloveniji trenutno izloˇcujemo ovne z alelami VRQ
Genetika praskavca in stanje v Sloveniji, Ljubljana september 2005
- p. 17/17