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première année IUT Thionville/Yutz
Cours de Biochimie structurale
LES PROTIDES Les acides aminés aliPhatiques cooH
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HOOC._CHz__CI{ Acide asPartique (Asp ou D) I
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NHa
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NH2_-çO-CHz__ôH Asparagine (Asn ou
(l)
I' o (tr
N)
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de transamination ; Asp et Glu jouent un rôle important dans les réactions la mise en réserve de Asn et Gln sont impliqués dans le transport et et chez les animaux' l,azote aminé, r"ap"atiu"ment chez les végétaux
NHz
c
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cooH
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Hooc-cH2--6rr.-[rr
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Aclde glutamique (Glu ou E)
NHz
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NH2
--çO-CH2-CHa-CH
Glutamine (Gln ou Q)
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NHz
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cooH I
NHz-.-CH2-g11..__CH2--CH2-CH Lysine (Lys ou
K)
est post'traduclio nnelle.
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l
NHz
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HzN. t"-
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cooH NH
Arginine (Arg ou R)
-cH2.-cH2-cHa__èu l
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d'énergie comrne Chez les inverlébrés, l'arginine-phosphate est réservoir l'est chez les vertébrés la créatine-phosphate'
g
NHe
"r(
le collagène) son hydroxylation en S-hydroxylysine (en particulier dans
COOH
Histidlne (His ou
---cHr--bu t*-*-.1..1 Nl'l
N .-
H)
NHz
-,
r f
précéderrls, His pourrait être Diaminé cornme les deux acides aminés imidazole)' rangé avec les acides aminés hétérocycliques (noyau
Les acides aminés cycliques
L/--cnr--lH
PhénYlalanine (Phe ou F)
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NHz
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TYroslne (TYr ou Y) |
dans Ces 3 acides amittés sont responsables (surtout Trp) de I'absorption le principe londe propriété spectrale protéines. Cette nm) des (à 280 l'UV du dosage spectrophotornétrique des protéines ; le groupernenl hydroxyle de Tyr peut s'engager dans dgt liaisons de hydrogène. C'est un groupenrent fonctionnel impàrtant pour I'activité
certains enzymes
N112
Tç, à
il tll t\\-r.''' l,l[.{
Tryptophane (Tç otr W)
t
Nt't?
.t Sa structure particulière itrtposu une rigitjitr: (coude) à la
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cr C)
). (] o
-c, *O)
c
deis
acides amirrés.
cooH
,1''.r------;r-CHr-*-!n
;
noyau indole (phenyl et pyrrole accolés), est le plus gr
cL)oll
f_-?* t-...-_-.
NH
Proline (Pro ou
P)
clraîne
est posti porypeptidiquc son hydroxylation en 4-hydroxyproline } traductionnellc i Nl{ J enoaoé dans une liaison peptidiquc, Pro perd sorr H du gr'ttpenrerrt. acicles I ;,;r;";*t .on,racter de liaison hydrogenc avec le Co d';rutrgs amines.
première année IUT Thionville/Yutz
Cours de Biochimie structurale
LES PROTIT}ES cture seconoarre oes proternes
Feuillet
B
de 80. entre les Plans
Hélice g
Iiaisons peptidiques
Schématisation de I 'hélice
cx,
et du feuillet p
ructure terûarre oes pro rnes Liaison ioniqur'
lnteraction dipôle-dipôlc
i::Ld {(, Liaisons (( secondaires
))
Schématisation de la structure tertiaire
Structure quaternaire des protéines
:..1:
i:r
Structure quaternaire de l'hémoglobine
Schématisation de la structure quaternaire
première année IUT ThionvilleA(utz
Cours de Biochimie structurale
LES PROTIDES Les différentes chromatographies
MI\ ffio''ï::;ïro'" I ooo,,io,' o, i glucose (G) i .t
M ffi
ffi:
W zTr L.Q\-rdÙ
iï1"::'
La filtration sur gel
Echangeuse d 'ions
Le SDS PAGtr
a olalyse
Mélange de macromolécules
Grosses molé
Gel poreux
L 'ultra centrifugation
Arrnored charnber
Sedimented sample
aI
Cours de Biochimie structurale
première année IIJT Thionville/Y utz
LES PROTII}ES Electrophorèse sur papier
t$!âirp u
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ouram cmtinu
Electrophorèse sur couche mince
Chromatographie échangeuse d'ions
Cours
de Biochimie structurale
première année IUT Thionville/Yutz
LES PROTIDES
Albumine Globulines cr% r I 59Vo 4Vo7,5Vo 12%
support : électrophorégramme après coloration des protéines (pH
Â. Eiectrophorèie sur Ligne de
17,SVo
g'o)'
départ
i
i
I
ry:ï,'#:î,ï::nl"î,,ï,3î:;i3;(i?J;:[:Lïffi':,"ammeaucororimètre: après coloration des glucides (glucidogramme) après coloration des lipides (lipidogramme)'
<-
Sens de migration
Echelle f-{
;B
l0
nm
.
Na+ Cl- Glucose
I I
a
æ Albumine
Fractionnement des protéines sériques pâr électrophorèse sur papier
Hémoglobine
65 000
$
64
c
Globuline
Y
Globuline
lt6
90 000
æ
01 Lipoprotéine ?00 000
4n
000
# F1
LiPoprotéine
Fibrinogène
'
Fractionnement des protéines sériques par électrophorèse en gel d'agarose
Æffi
Représenntion schématique d'une molécule d,hé_' mogtotTtne A, montant les 4 sous-unités.ll y aZ chaînes po_, lypeptidiques d et deux chaînes p, châcune contenant une molécule d'hème.
WW N I
l(imioa zole)
Hémoglobine désoxYgénée
Oxyhémoglobine
Structure de I'hémoglobine et de la myoglobine
Dimensions et poids moléculaires de quelques protéines du sang