MÉTODOS DE ESTUDIO Y CONTROL DE LOS MICROORGANISMOS
Dra. M. E. Arias Fernández Dpto. Microbiología y Parasitología E-mail:
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PROGRAMA • Métodos de observación de los microorganismos El microscopio. Tipos de microscopios. Preparación y examen de muestras. Tipos de tinciones.
• Métodos de aislamiento de los microorganismos • Crecimiento de los microorganismos:
•
Nutrición microbiana: requerimientos nutritivos Cultivo de los microorganismos: medios de cultivo Crecimiento microbiano: curva de crecimiento Determinación del crecimiento. Influencia de los factores ambientales sobre el crecimiento Microorganismos extremófilos
Control de poblaciones microbianas: Métodos físicos: Esterilización y otros métodos Métodos químicos: desinfectantes, antisépticos y esterilizantes Agentes antimicrobianos: antibióticos y quimioterapéuticos de síntesis
MÉTODOS DE OBSERVACIÓN DE LOS MICROORGANISMOS
MICROORGANISMOS MICROORGANISMOS PROTOZOOS BACTERIAS VIRUS
HONGOS ALGAS
MICROSCOPIO ELECTRÓNICO MICROSCOPIO ÓPTICO VIRUS 1 nm
10
SUBVIRICAS
102
BACTERIAS 103
EUCARIOTAS 104
1 µm
RANGO DE TAMAÑO DE LOS MICROORGANISMOS
105
106 1 mm
TIPOS DE MICROSCOPIOS • Microscopio óptico:
Microscopio de campo claro Microscopio de campo oscuro Microscopio de contraste de fases Microscopio de fluorescencia Microscopio de láser confocal
• Microscopio electrónico: De barrido De transmisión
• Microscopio de fuerza atómica (AFM)
EL EL MICROSCOPIO MICROSCOPIO ÓPTICO ÓPTICO
CAMPO CLARO
CAMPO OSCURO
CONTRASTE DE FASES
FLUORESCENCIA
CONFOCAL
EL EL MICROSCOPIO MICROSCOPIO ELECTRÓNICO ELECTRÓNICO MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE BARRIDO (SEM) Haz de electrones que “barre” la superficie de un objeto sólido
Resolución: < 7nm MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA DE TRANSMISIÓN (TEM) Haz de electrones que atraviesa cortes ultrafinos de una muestra
Resolución: 5 Å
Manipulando átomos...
Microscopio de efecto túnel Microscopio de fuerza atómica Obtiene imágenes con resolución de menos de 1 nm
Observación de una espora de Aspergillus oryzae atrapada en un poro con microscopio de fuerza atómica
TIPOS TIPOS DE DE TINCIONES TINCIONES TINCIÓN TINCIÓN SIMPLE SIMPLE
TINCIÓN TINCIÓN DIFERENCIAL DIFERENCIAL TINCIÓN DE Ziehl-Neelsen
TINCIÓN DE GRAM
TINCIONES TINCIONES ESPECÍFICAS ESPECÍFICAS TINCIÓN DE CÁPSULA
TINCIÓN DE FLAGELOS
TINCIÓN DE ESPORAS
MÉTODOS DE AISLAMIENTO DE LOS MICROORGANISMOS
MÉTODOS DE AISLAMIENTO DE CULTIVOS PUROS
• Siembra por estría en placa Petri • Vertido en placa • Extensión en placa: - Diluciones seriadas - Asa de Digralsky
MÉTODOS MÉTODOS DE DE AISLAMIENTO AISLAMIENTO DE DE CULTIVOS CULTIVOS PUROS PUROS SIEMBRA POR ESTRÍA EN PLACA DE PETRI
MÉTODOS MÉTODOS DE DE AISLAMIENTO AISLAMIENTO DE DE CULTIVOS CULTIVOS PUROS PUROS DILUCIONES SERIADAS
Extensión en placa
Vertido en placa
MEDIOS DE CULTIVO
Medios definidos Medios complejos Medios selectivos Medios diferenciales Medios selectivos y diferenciales Medios de enriquecimiento
MEDIOS DE CULTIVO COMPOSICIÓN DE UN MEDIO DEFINIDO Y UN MEDIO COMPLEJO • Medio definido
Glucosa…………. 10 g (NH4)2SO4…………. 2 g CaCl2 ……….......0,01 g FeSO4.7H2O…..0,005 g MgSO4.7H2O…..0,02 g Agua destilada…… 1 L Agar……………… 15 g
• Medio complejo: caldo nutritivo Peptona…………… 5 g Extracto de carne.. 3 g NaCl…………………8 g Agua destilada…….1 L
MEDIOS DE CULTIVO Medios selectivos y diferenciales
Agar BairdParker
Agar Entérico de Hektoen (Enterobacterias patógenas)
(Estafilococos)
Agar Levine (EMB) (Coliformes)
Agar Wilson-Blair (Salmonella)
Medios de enriquecimiento
Caldo Giolitti-Cantoni (Estafilococos)
Caldo Müller-Kauffmann (Salmonella)
CRECIMIENTO Y CONTROL DE LOS MICROORGANISMOS
NUTRICIÓN NUTRICIÓN MICROBIANA: MICROBIANA: REQUERIMIENTOS REQUERIMIENTOS NUTRITIVOS NUTRITIVOS Fuente de carbono: - CO2: Autótrofos - Compuestos orgánicos: heterótrofos
Fuente de energía: generación de ATP y poder reductor - Luz: fototrofos - Compuestos químicos: quimiotrofos - compuestos orgánicos: quimioorganotrofos - compuestos inorgánicos: quimiolitotrofos
Tipos nutricionales de los microorganismos: Fotoautótrofos Fotoheterótrofos Quimiolitotrofos autótrofos Quimiolitotrofos heterótrofos: mixotrofos Quimioorganotrofos heterótrofos (quimioheterótrofos)
CADENA CADENA METABÓLICA: METABÓLICA: ETAPAS ETAPAS
1- ENTRADA DE NUTRIENTES
CADENA CADENA METABÓLICA: METABÓLICA: ETAPAS ETAPAS
2- REACCIONES CATABÓLICAS
CADENA CADENA METABÓLICA: METABÓLICA: ETAPAS ETAPAS
3- BIOSÍNTESIS
CADENA CADENA METABÓLICA: METABÓLICA: ETAPAS ETAPAS
4- POLIMERIZACIÓN
CADENA CADENA METABÓLICA: METABÓLICA: ETAPAS ETAPAS
5- ENSAMBLAJE
FUENTE DE NITRÓGENO (Nitrosomonas, Nitrobacter)
(Azotobacter, Cianobacterias)
Inorgánica: - NH4+ - NO3- N2
(Clostridium, fototrofas rojas y verdes) (Bacillus, Pseudomonas)
Compuestos orgánicos nitrogenados: - aminoácidos - bases nitrogenadas, etc.
OTROS REQUERIMIENTOS NUTRICIONALES Fósforo: Fosfato
Azufre: - SO4 2- SH2 - Compuestos orgánicos azufrados
(Thiobacillus, Beggiatoa,Fototrofos erobios)
(Desulfovibrio, Desulfobacter)
(Desulfuromonas, Archaea term.) (B. Fototróficas rojas y verdes)
K, Mg, Na, Ca, Fe, etc. Micronutrientes: Cr, Co, Cu, Mn, Mo, etc. Factores de crecimiento: vitaminas, aminoácidos, purinas, pirimidinas, etc.
CRECIMIENTO CELULAR Y DE POBLACIONES
• División celular en procariotas Fisión binaria
1 2 3 4
El tiempo para completar el ciclo depende de factores nutricionales y genéticos
1.
Contraste de fases
2.
Tinción de nucleoide
3.
Tinción del anillo FtsZ
4.
Tinción de nucleoide y anillo
CRECIMIENTO CELULAR Y DE POBLACIONES
• Crecimiento de poblaciones - Velocidad de crecimiento - Tiempo de generación - Expresión del crecimiento Crecimiento exponencial de un cultivo bacteriano que se inicia con una sola célula y que tiene un tiempo de generación de 30 min:
Datos de una población que se duplica cada 30 minutos
Datos representados en distintas escalas
CRECIMIENTO CELULAR Y DE POBLACIONES
• Curva de crecimiento: sus fases
DETERMINACIÓN DEL CRECIMIENTO RECUENTO DIRECTO AL MICROSCOPIO
TURBIDIMETRÍA
DETERMINACIÓN DEL CRECIMIENTO RECUENTO DE VIABLES
EFECTO EFECTO DE DE FACTORES FACTORES AMBIENTALES AMBIENTALES SOBRE SOBRE EL EL CRECIMIENTO CRECIMIENTO
• Temperatura
Tasa de Crecimiento
Reacciones enzimáticas a la máxima velocidad posible Reacciones enzimáticas incrementando sus velocidades de reacción
Gelificación de membrana; proceso de transporte demasiado lento para soportar el crecimiento
Desnaturalización de Proteínas; Colapso de la membrana; citoplasmática; lisis térmica
Temperatura mínima y óptima
EFECTO EFECTO DE DE FACTORES FACTORES AMBIENTALES AMBIENTALES SOBRE SOBRE EL EL CRECIMIENTO CRECIMIENTO
• Temperatura
Tipos de microorganismos según su temperatura óptima
Termófilos Mesófilos
Psicrófilos
Hipertermófilos
Hipertermófilos
EFECTO EFECTO DE DE FACTORES FACTORES AMBIENTALES AMBIENTALES SOBRE SOBRE EL EL CRECIMIENTO CRECIMIENTO
Salinidad
Halófilo: discretos (1-6 %) y moderados (6-15 %) de NaCl Halotolerante: crecen en amplio rango de actividad de agua Halófilos extremos: 17-36 % NaCl
Anaerobios aerotolerantes
Microaerófilos
Facultativos
Anaerobios
Aerobios
Medio Medio concon tioglicolato tioglicolato y y resazurina resazurina
Tipos de microorganismos en relación con el oxígeno
CULTIVO DE ANAEROBIOS
Catalizador (Pd) 2H2+O2
2H2O H2
Radicales tóxicos del oxígeno
Pyrococcus furiosus
Enzimas que destruyen radicales tóxicos del O2
MÉTODOS MÉTODOS DE DE CONTROL CONTROL MICROBIANO: MICROBIANO: TERMINOLOGÍA TERMINOLOGÍA Esterilización: destrucción total de formas vivas/material inerte Desinfección: destrucción/inhibición de agentes infecciosos en estado vegetativo en material inerte desinfectantes Antisepsia: destrucción/inhibición de agentes infecciosos en estado vegetativo en la superficie de tejidos vivos antisépticos Saneamiento: reducción población microbiana en material inerte o tejidos vivos hasta niveles seguros limpieza mecánica/productos Quimioterapia: control crecimiento microbiano dentro de un hospedador agentes quimioterapéuticos antimicrobianos
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
• Métodos físicos: esterilización por calor Calor seco Flameado (incineración)
Horno Pasteur (170°C/ 1-2h)
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
• Métodos físicos: esterilización por calor Calor húmedo Hervido (100°C)
Esterilización a temperatura ultraelevada (UHT)
Tindalización (100°C) Vapor de agua a presión: el autoclave (121°C/ 20min)
Pasteurización: Reducción de población microbiana y alargamiento vida útil
HTST: 71-72°C durante 15 seg.
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
Métodos físicos: esterilización por filtración Filtración de soluciones termosensibles
Filtración del aire: Algodones en los tubos de vidrio, mascarillas Filtro de alta eficacia de retención de partículas (HEPA) Cabinas de seguridad biológica de flujo laminar Habitaciones especiales de hospitales (inmunosuprimidos)
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
Métodos físicos: esterilización por radiación Depende de la energía (λ), intensidad y duración
Radiaciones utilizadas: IONIZANTES (λ < 200nm) (60Co
137Cs)
Rayos γ y Rayos de electrones Rayos X
NO IONIZANTES (λ > 200nm) Luz UV (λ = 260nm) Microondas
Suministros quirúrgicos, medicamentos, materiales de laboratorio, industria alimentos, productos cárnicos
Desinfección de superficies, aire, etc.
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
Métodos físicos: otros métodos Control por bajas temperaturas Congelación Refrigeración (0-5°C)
Desecación Evaporación (Industria alimentaria) Liofilización (conservar cultivos, hemoderivados, etc)
Soluciones hipertónicas (salazón, miel, mermeladas, etc)
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
• Métodos químicos Propiedades de los agentes químicos: 1. 2. 3. 4. 5.
Inocuo para las personas y no corrosivo para materiales Amplio espectro Eficaz a diluciones altas y en presencia de materia orgánica Soluble en agua Estable, inodoro y económico Tipos de agentes químicos: Antisépticos Desinfectantes Esterilizantes
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
• Métodos químicos Principales grupos de antisépticos: AGENTE
APLICACIÓN
Alcohol (60-85% etanol)
Piel
Fenoles (hexaclorofeno,
Jabones, lociones, cosméticos y desodorantes
Detergentes catiónicos
Peróxido de hidrógeno al 3%
Piel
Compuestos de yodo (Betadine)
Piel
Nitrato de Plata
Ojos neonatos
triclosan, clorhexidina) (cloruro de benzalconio)
Jabones y lociones
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
• Métodos químicos Principales grupos de desinfectantes y esterilizantes AGENTE
APLICACIÓN
Alcohol (60-85% etanol)
Instrumental médico
Gas Cloro
Suministro de agua
Compuestos Clorados
Industria alimentaria (equipos)
Detergentes catiónicos
Formaldehído (3-8%)
Superficies
Sulfato de cobre
Algicida
Óxido de etileno (gas)
Esterilizante de material termosensible
(amonio cuaternario)
Instrumental médico, alimentos y equipos de industria lácteas
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO
• Métodos químicos Agentes antimicrobianos: antibióticos y quimioterapéuticos de síntesis
Antibiogramas
Howard Florey y Ernst Chain Alexander Fleming
Penicilinas Sulfanilamida Gerhardt Domagk
Bacteriostático
Bactericida
Tipos de agentes antimicrobianos
Bacteriolítico
CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO Antibióticos: microorganismos productores Bacterias Actinomicetos (4600) Bacillus (950) Hongos (1600) Plantas 5Metoxihidrocarpaina
Animales
PROBLEMAS ACTUALES EN TERAPIA
Aumento de resistencias: Abuso y mal uso de los antibióticos Enfermedades crónicas
Soluciones: Uso restringido de los antibióticos
Búsqueda de nuevos antimicrobianos
Mejora de los ya existentes