Informe Bioinformatica Completo.docx

LA BIOINFORMATICA “THE BIOINFORMATICS”

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Cely García María Camila-1611302; 2Mejia Morales Angelica Dayana-1611314; 3Gutierrez Flores Arley Andres-1611298; 4Moreno Pérez José Neftali-1611349. 1

[email protected]; [email protected]; 3 [email protected]; [email protected]

Universidad francisco de paula Santander, facultad de ciencias agrarias y del ambiente, ingeniería biotecnológica- biología molecular, grupo A; 14 de marzo del 2019.

RESUMEN

En este artículo se basa en la búsqueda de artículos científicos para esto se deben buscar en fuentes las cuales proporcionen información verídica y confiable, para esto se utilizaron las diferentes bases de datos, como una guía en la cual se nos muestras una serie de pasos de la manera correcta para la búsqueda de estos documentos los cuales cuenta con información confiable. Se presentan 3 bases de datos: NCBI BOOKS (centro nacional de información biotecnológica), EMBL (European molecular biología laboratory), PUBMED, de las cuales se pudo obtener el artículo científico de acuerdo al tema de investigación que correspondió. Palabras clave: bases de datos, NCBI BOOKS, PUBMED, EMBL.

ABSTRACT

In this article, it is based on the search of articles so that it can be used in sources that provide true and reliable information, for this the different databases are used, as a guide in which we are shown a series of steps of correct for the search of these documents. Three databases are presented: NCBI BOOKS (National Center for Biotechnological Information), EMBL (European Molecular Biology Laboratory), PUBMED, from which the article can be obtained according to the topic of the corresponding research. Keywords: databases, NCBI BOOKS, PUBMED, EMBL.

INTRODUCCIÓN Un vector en biología molecular e ingeniería genética es un elemento utilizado para el transporte de la información genética de una célula a otra y que por sus características genera un interés para la ciencia, en la actualidad existen dos tipos de vectores los denominados vectores de expresión y los vectores de clonación los cuales tienen distintas funciones. Los vectores de expresión se encargan de expresar la información genética dentro de la célula huésped y que requieren de una región que controle la expresión genética la cual es regulada por un promotor de características fuerte e inducible lo que permite regular el proceso de expresión. (Herráez, A. 2012.) Por otra parte los vectores de clonación se utilizan en la amplificación del DNA de interés para ser incorporado en la célula huésped, estos poseen un sitio de origen de replicación que permite su propagación de forma automática en la célula huésped. Existen distintos vectores empleados en la clonación del DNA uno de estos son los plásmidos los cuales son cadenas circulares de doble hélice de un tamaño de hasta 200 Kpb y que pueden generar de 2 a 3 mil copias por célula, el bacteriófago λ es un vector para la

clonación basado en virus que puede clonar hasta 16 Kb, los cosmidos que pueden clonar hasta 49 Kpb y se reproducen en la célula huésped como un plásmido y por último los denominados vectores YAC y BAC los cuales pueden clonar cientos de Kb, los YACs son empleados para la replicación en levaduras y los BACs se emplean en la replicación en E. coli.( Voet, D & Voet, J 2006.) Sin embargo con la evolución de la ciencia también se desarrolla la tecnología es por ello que surge la bioinformática como una herramienta de apoyo a los procesos de recopilación de información científica que en el ámbito de la genética y la biología molecular suministre información acerca de los distintos genes, y proteínas de interés por ejemplo plataformas como BLAST, NUCLEIC ACID RESEARCH y GENBANK y otras más fueron bases gratuitas creadas mediante bioinformática que sirva a los investigadores como una herramienta útil en el desarrollo de proyectos de investigación. (Cordón García, J.2010). Por ello el objetivo de este informe es buscar un artículo de interés en base al tema vectores de clonación usando las distintas bases de libre acceso y mostrar el proceso de búsqueda en dichas bases.

METODOLOGIA

Definir la palabra clave

BUSCAR La base de datos correspondiente al tema que se quiere tratar Detallar e investigar los artículos propuestos Especificar contenido que se escogerá Determinar material

RESULTADOS Los registros o bases de datos son herramientas de trabajo capaces de proporcionar información sobre una actuación concreta en la población como un todo, ofreciéndonos una estimación de las tendencias recientes y los riesgos de futuro a escala nacional (Rodríguez et al., 2004). Las bases de datos han sido para las organizaciones una herramienta de uso indispensable, pues este permite almacenar un conjunto de datos pertenecientes a un mismo contexto ya que nos facilitan y regulan el proceso de análisis y desarrollo científico. Es indispensable ya que se usa como método de encontrar información mucho más

rápida y con menos riesgo de perdidas; entre más datos sean almacenados en una base de datos se convierte más útil, esta puede llegar a proporcionar a las personas y organizaciones el acceso de datos donde podemos visualizar, ingresar o actualizar información. Una de las principales bases de datos utilizadas al momento de buscar el respectivo artículo fueron: 1. NCBI BOOKS (centro nacional de información biotecnológica) Es la base de datos más importante de la National Library of Medicina (NLM), abarcando los campos de medicina, oncología, enfermería, odontología,

veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas. De entre sus herramientas/plataformas más conocidas destaca por encima de todas PubMed; un portal de búsqueda desarrollado por la National Center for Biotechnology Information (NCBI) en la NLM. Pero

además de PubMed en MEDLINE podemos encontrar otras herramientas/plataformas como NCBI BookShelf.

Figura 1. Base de datos NCBI BOOKS

2. EMBL (European biología laboratory)

molecular

Es una institución de investigación en biología molecular financiada por 18

países europeos. Fue creado en 1974 y tiene laboratorios en Heidelberg, Alemania, Hamburgo, Alemania, Grenoble (Francia) y Hinxton (Reino Unido), y un Programa de Investigación en Monterotondo, Italia.

Figura 2. Base de datos EMBL

3. PUBMED PubMed es un motor de búsqueda de libre acceso a la base de datos MEDLINE de citaciones y resúmenes de artículos de investigación biomédica. Ofrecido por la Biblioteca

Nacional de Medicina de los Estados Unidos como parte de Entrez. MEDLINE tiene alrededor de 4800 revistas publicadas en Estados Unidos y en más de 70 países de todo el mundo desde 1966 hasta la actualida.

Figura 3. Base de datos PubMed.

DISCUSIONES

(estadísticas, libros, artículos de revista,

La bioinformática es considerada por

tesis doctorales…) y, por tanto, los

algunos como la biología computacional

recursos que nos permiten acceder a ellas.

gracias a la aplicación de técnicas

El desarrollo de las nuevas tecnologías y

analíticas

el

la facilidad de publicación en la red,

modelamiento de sistemas biológicos, es

sumado a la gran cantidad de información

decir, son “los métodos matemáticos,

disponible, fueron imprescindibles para

estadísticos

que

acudir a fuentes que nos garantizaron, la

problemas

obtención de información fiable y de

biológicos usando secuencias de ADN y

calidad, como por ejemplo los catálogos o

aminoácidos e información relacionada".

las bases de datos. Por otra parte, nuestras

(Tekaia F, 2010)

búsquedas fueron precisas y eficaces, y se

La búsqueda de información es un

obtuvieron resultados pertinentes.

proceso de carácter global en el que

De

intervienen

documentación

y

pretenden

cuantitativas

y

computacionales

solucionar

una

interrelacionados

para

serie entre

de sí.

factores (Medina,

entre

ese

gran

volumen

existente

de

logramos

obtener un artículo de investigación en la

J.2012).

página PUBMED.

La finalidad para este informe fue la

Existen otras bases de datos entre las que

búsqueda

están: google académico, ScienceDirect,

VECTORES

de

información DE

sobre

CLONACION,

scielo

entre

muchas

más,

pueden

utilizando diferentes páginas web, para

proporcionar

esto se tuvo en cuenta el tema a consultar,

información pero con poca filtración de

el

tipo de fuentes

de información

una

larga

lista

de

datos, por lo que la búsqueda se hace más extensa y los resultados pueden tener

BIBLIOGRAFIA

ciertas variaciones, aun así son bases de datos que también pueden tomarse en cuenta para la investigación. Una herramienta muy importante que brinda cada una de estas bases de datos estudiadas es la capacidad de agregar investigaciones realizadas en la base de datos para la posterior revisión y en dado caso publicación.

CONCLUSIONES 

Se debe tener la certeza que la información que se está buscando se realice en fuentes confiables



Tratar de que la información se lo mas reciente posible, en un rango de 10 años



Aprovechar las diferentes base de datos

que

disposición

están

a

nuestra

Cordón García, J. A. et al. Las nuevas fuentes de información: información y búsqueda documental en el contexto de la web 2.0. Madrid. Pirámide, 2010. Herráez, Ángel, 2012. Expresión génica, pp 223-224. Biología molecular e ingeniería genética, 2da edición, ElSilver, Barcelona, España. ISBN: 987-84-8086647-7. Planas, M., Rodriguez, R., Lecha, M.(2004). La importancia de los datos (en línea). Scielo. 19, http://scielo.isciii.es/scielo.php?script=sci _arttext&pid=S021216112004000100003; consulta: Marzo de 2019. MEDINA J. GARZON F. TAFURTH P. BARBOSA J. Recopilacion bioinformatica. Universidad Distrital Francisco Jose de Caldas. 2012. Tekaia F, 2010. Unité de Génétique Moléculaire des Levures, Institut Pasteur, París, Francia. Voet, Dolald & Voet, Judiht, 2006. Clonación molecular, pp 213-214, bioquímica, 3era edición, editorial medica panamericana, Buenos aires, Argentina. ISBN: 950-06-2301-3.