Biokemija

Opišite pomen citratnega ciklusa v metabolizmu glukoze. 1. Katera od aminokislin na sliki 1 vstopa v -kovalentno katalizo B -kovalentno modifikacijo s fosforilacijo -Na prazen prostor na sliki 1 narišite peptid CysTyrGly -Kakšen naboj ima ta peptid pri pH 7 -Katera od aminokislin na sliki 1 je najmanj polarna

D

2. Katere interakcije se pri procesu zvijanja proteinov v nativno konformacijo vzpostavijo nazadnje? a) ionske interakcije b) hidrofobne interakcije c) vodikove vezi d) van der Waalsocve interakcije e) disulfidne vezi 3. Kateri od naštetih proteinov ima največji delež hidrofobnih aminokislin v notranjosti molekule? a) kolagen b) elastin c) fibroin d) tripsin e) fibrin 4. Katera od naštetih trditev velja za stranske verige aminokislin v α-vijačnici? a) obrnjene so v notranjost vijačnice b) orientirane so izmenjujoče se nad in pod ravnino c) enak naboj na verigah sosednjih aminoklislin destabilizira strukturo d) vodikove vezi med njimi stabilizirajo vijačnico e) so izmenilčno obrnjene ven in v notranjost vijačnice 5. Na prostor na sliko 2 narišite Lineveawer-burkov diagram za kompetitivno inhibicijo s tremi koncentracijami inhibitorja. Označite premico z največjo koncentracijo inhibitorja. 6. V kateri razred encimov spada encim, ki za svoje delovanje potrebuje koencim na sliko 5? a) oksidoreduktaze b) transferaze c) hidrolaze d) liaze e) izomeraze 7. Za aktivno mesto encimov velja, da a) ga sestavljajo praktično vse ionizirajoče stranske skupine aminokislin v proteinu b) je lahko zgrajen samo iz ene aminokisline c) so aminokisline, ki ga tvorijo, daleč narazen glede na aminokislinsko zaporedje d) vključuje praktično celotno molekulo encima

e) ga lahko tvorijo izključno hidrofobne aminokisline 8. Pri alosteričnih encimih je oblika R v primerjavi z obliko T a) manj stabilna b) manj aktivna c) ima manjšo afiniteto do substrata d) ima manjšo afiniteto do pozitivnega alosteričnega efektorja e) ima manjšo afiniteto do negativnega alosteričnega efektorja 9. Sigmoidna odvisnost hitrosti encimsko katalizirane reakcije od koncentracije substrata je posledica a) kvartarne strukture encima b) kvartarne strukture substrata c) heterotropične alosterične modifikacije encima d) kovalentne modifikacije encima e) kooperativne vezave substrata 10. Ddejstvo, da protitelesa proti analogu prehodnega stanja katalizirajo reakcijo, dokazuje, da a) imajo protitelesa več bioloških vlog b) velik delež katalize odpade na destabilizacijo substrata c) se zaradi vezave prehodnega stanja na protein reakcija pospeši d) encimi delujejo po modelu ključa in ključavnice e) encimi delujejo po modelu induciranega prileganja 11. Glukoza transporter (protein, ki omogoča olajšano difuzijo glukoze) a) omogoča prehod ionom b) ima vezavno mesto za glukozo in druge monosaharide c) se med delovanjem konformacijsko spreminja d) je integralni protein z enim transmembranskim segmentom e) je proteinski kanal, ki je dovolj velik, da skozenj prehaja glukoza in vse molekule manjše od glukoze 12. Kateri od naštetih proteinov se aktivira zaradi vezave molekule na sliki 3 na njegovo regulacijsko podenoto? a) kalcijevi kanalčki na membrani endoplazemskega retikula b) protein-kinaza C c) fosforilaza-kinaza d) fosfoprotein-fosfataza e) glikogen-fosforilaza 13. Katera od naštetih trditev ne velja za encim protein-kinaza A (PKA)? a) regulatorni dimer (r)se s katalitično podenoto (c) asociira v (r2c2) preko psevdo substratnega zaporedja b) cANP se veže na katalitični podenoti in povzroči njihovo konformacijsko spremembo c) peptid z psevdosubstratnim zaporedjem je dober inhibitor katalitične podenote d) encim katalizira fosforilacijo proteinov e) po katalizi sodeluje Mg2+

14. Za lipidni dvosloj velja, da a) imajo posamezne molekule dvosloja možnost prostega prehoda z ene plasti v drugo b) skozenj lahko prosto prehajajo majhne, nepolarne molekule c) je pri vseh bioloških membranah enak d) nastaja na posebnih nukleoproteinskih delcih e) je zgrajen simetrično (obe plasti sta praktično enaki) 15. Za O-vezane oligo saharide glikoproteinov velja, da a) nastanejo v endoplazemskem retikulu b) se najprej sintetizirajo in nato vežejo na protein c) vsebujejo veliko manoze d) se vežejo na C-konce polipeptidne verige e) so največkrat vezani na serin ali treonin 16. Pri popolni hidrolizi sfingolipidov lahko dobimo ves razen a) holina b) sfingozina c) glicerola d) palmitinske kisline e) fosfata 17. Na sliki 8 povežite metabolične intermediate v shemo metabolizma glikoze v jetrih po intenzivnem mišičnem delu. 18. Del katerega metaboličnega procesa je reakcija na sliki 6? V kateri razred encimov spada encim, ki katalizira reakcijo na sliki 6? 19. Del katerega metaboličnega procesa je reakcija na sliki 7? V kateri razred encimov spada encim, ki katalizira reakcijo na sliki 7? V katerem razdelku celice poteka reakcija na sliki 7? 20. Če je ΔG°' reakcije fosfokreatin + H2O → kreatin + HPO32- -43 kJ/mol, ΔG°' reakcije ATP + H2O → ADP + HPO32- -30 kJ/mol, potem je ΔG°' reakcije, ki jo katalizira encim kreatin kinaza v mišicah pri intenzivnem delu? a) -73 kJ/mol b) +73 kJ/mol c) -13 kJ/mol d) +13 kJ/mol e) +43 kJ/mol 21. Za reakcijo kompleksa kompleksa piruvat-dehidrogenaza velja, da omogoča vstop a) glicerola v sintezo glukoze b) glukoze v sintezo maščobnih kislin c) piruvata v sintezo alanina d) acetilkoencima A v sintezo maščobnih kislin e) maščobnih kislin v aerobno oksidacijo 22. Kaj prikazuje slika 10?

Na sliki 10 označite skupine, ki so se pripele v Golgijevem aparatu. 23. Glioksilatni ciklus se razlikuje od citratnega po tem, da a) v celoti poteka v matriksu mitohondrija b) v njem ne pride do oksidacije acetilne skupine c) poteka samo v živalskih organizmih d) v njem sodeluje encim citrat-sintaza e) je izocitrat njegov intermediat 24. Inzulin vpliva na hitrost sin teze maščobnih kislin v adipocitih taki, da a) aktivira sintazo maščobnih kislin b) stimulira prenos glukoze v celice c) pospeši krebsov cikel d) inaktivira acetilkoencim A-karboksilazo e) aktivira piruvat-karboksilazo 25. Receptor za glukagon a) je integralni membranski protein s 7 TMS b) je integralni membranski protein z 1 TMS c) ni integralni membranski protein d) ni protein e) je v membrano zasidran s hidrofobnim sidrom 26. Povečana koncentracija katere od naštetih snovi bo najverjetneje v hepatocitih pospešila biosintezo maščobnih kislin? a) cAMP b) diacilglicerol c) citrat d) laktat e) ioni Ca2+ 27. Če suspenziji mitohondrijev, ki vsebuje ADP in NADH, dodamo 2,4-dinitrofenol, ki omogoča prenos H+ preko membran, se bo upočasnila a) dihalna veriga b) poraba kisika c) fosforilacija ADP d) oksidacija NADH e) oksidacija FADH2 28. V zadnjem obratu β-oksidacije maščobnih kislin nastane a) 1 NADPH, 1 FADH2, 1 Ac-CoA b) 1 NADH, 1 FAD, 1 Ac-CoA c) 1 NADH, 1 FADH2, 2 Ac-CoA d) 1 NADH, 1 FADH2, 1 Ac-CoA e) 2 NADPH, 1 Ac-CoA 29. Za ubikinon ali koencim Q velja, da a) je v lipidih topen prenašalec elektronov b) v vodi topen prenašalec elektronov c) prenaša elektrone direktno na kisik d) prenaša elektrone direktno na citokrom C

e) v vodi topen prenašalec protonov 30. Za encime aminotransferate velja, da a) katalizirajo ireverzibilne reakcije b) sodelujejo pri biosintezi aminokislin c) katalizirajo enosubstratno reakcijo d) potrebujejo za svoje delovanje biotin e) prenašajo skupine z enim C-atomom 31. Aminoacil-tRNA-sintetaze so pomembni encimi pri sintezi proteinov. Kaj velja zanje? a) v ribosomu povežejo aminokislinske ostanke s peptidno vezjo b) v jedru prepisujejo gene za tRNA c) na antikodonsko zanko pripenjajo aminokisline d) aktivirajo aminoacilne skupine in jih pripenjajo na tRNA e) aminokislinske vežejo na tRNA preko 5'-konca akceptorskega debla 32. Mitohondriji imajo lastno DNA in za njeno izražanje veljajo nekatere posebnosti. Katere? a) Mitohodrij ima en sam linearen kromosom, ki se ne prepisuje. b) Mitohondrij ima en sam linearen kromosom, ki ne zapisuje za vse mitohondrijske encime. c) Pri prepisovanju ni transkripcijskega mehurčka d) Prevajanje mitohondrijske mRNA ne poteka na ribosomih e) Raba kodona je pri mitohondrijski DNA drugačna kot pri celični 33. Plazmid je a) negativno nadrazvita krožna dvoverižna DNA b) relaksirana krožna dvoverižna DNA c) negativno nadrazvita linearna dvoverižna DNA d) negativno nadrazvita krožna enoverižna DNA e) negativno nadzvita krožna enoverižna RNA 34. Na prazen prostor na sliki 13 narišite replikacijske vilice in označite 5' konce nukleinskih kislin. Naštejte proteine, ki so potrebni za potek tega procesa. Na sliki označite mesto, kjer se je ta proces začel 35. Kateri od naštetih encimov ne sodelujejo pri zorenju evkariontske RNA a) različne RNaze b) poli-A-polimeraze c) katalitično aktivne RNA d) RNA-polimeraze e) RNA-metilaze 36. Na prazen prostor na sliki 14 narišite shemo iniciacijskega kompleksa pri translacijiNa sliki označite 5' konce nukleinskih kislin 37. Za Okazakijeve fragmente velja vse, razen da a) se sintetizirajo samo ob zaostajajoči verigi b) se podaljšujejo v smeri 3' → 5'

c) nastajajo v procesu podvojevanja DNA d) se njihova sinteza začne z delovanjem primaze e) se povezujejo s pomočjo encima DNA-ligaza 38. Katera od naštetih lastnosti transkripcije ni tudi lastnost replikacije? a) poteka unidirekcionalno b) potrebuje dvovijačno DNA za matrico c) v procesu pride do sinteze fosfoestrske vezi d) se začne na točno določenih mestih e) v proces vstopajo nukleotzidtrifosfati