Para la Copa Mundial, la FIFA eligió 23 árbitros profesionales de un total de 44. De éstos, el guatemalteco Carlos Batres, el griego Kyros Vasaras y el español Manuel Mejuto González renunciaron por problemas de salud, siendo substituidos por el italiano Roberto Rosetti, el español Luis Medina Cantalejo y el mexicano Marco Antonio Rodríguez. Por otro lado, el árbitro italiano Massimo De Santis fue suspendido por la FIFA debido a las irregularidades acontecidas en la temporada 2005/06 de la liga italiana, mientras el árbitro jamaiquino Peter Prendergast se lesionó días antes del inicio del evento. Ninguno de los dos árbitros fue reemplazado, reduciendo la lista finalmente a 21. Markus Merk Horacio Elizondo Mark Shield Frank De Bleeckere Coffi Codjia Carlos Simón Óscar Julián Ruiz Luboš Michel Luis Medina Cantalejo Esam El Deen Abd El Fatah Eric Poulat Roberto Rosetti Graham Poll Toru Kamikawa Valentin Ivanov Armando Archundia Marco Antonio Rodríguez Carlos Amarilla Shamsul Maidin Massimo Busacca Jorge Luis Larrionda
Los 32 equipos que participan en la fase final se dividen en ocho grupos de cuatro equipos cada uno. Dentro de cada grupo cada equipo juega tres partidos, uno contra cada uno de los demás miembros del grupo. Según el resultado de cada partido se otorgan tres puntos al ganador y ninguno al perdedor, en caso de empate se otorga un punto a cada equipo.
Pasan a la siguiente ronda los dos equipos de cada grupo mejor clasificados. El orden de clasificación se determina teniendo en cuenta los siguientes criterios, en orden de preferencia: 1. 2. 3.
El mayor número de puntos obtenidos teniendo en cuenta todos los partidos del grupo La mayor diferencia de goles sumados teniendo en cuenta todos los partidos del grupo El mayor número de goles a favor anotados teniendo en cuenta todos los partidos del grupo
Si dos o más equipos quedan igualados según los criterios anteriores sus posiciones se determinarán mediante los siguientes criterios, en orden de preferencia: 1. 2. 3. 4.
El mayor número de puntos obtenidos entre los equipos en cuestión La diferencia de goles teniendo en cuenta los partidos entre los equipos en cuestión El mayor número de goles a favor anotados por cada equipo en los partidos disputados entre los equipos en cuestión Sorteo del comité organizador de la Copa Mundial
La segunda ronda incluye todas las fases desde los octavos de final hasta la final. El equipo ganador de cada partido pasa a la siguiente fase, y el perdedor queda eliminado del campeonato. Los equipos perdedores de las semifinales juegan un partido por el tercer y cuarto puesto. En el partido final el ganador obtiene la Copa del Mundo. Si luego de los 90 minutos de juego el partido se encuentra empatado se juega un tiempo extra de dos etapas de 15 minutos cada una. Si el resultado sigue empatado tras este tiempo extra el partido se define por una tanda de cinco tiros penales. El equipo que menos falle será el ganador. Si después de esta tanda de penales siguen ambos equipos empatados se recurre a la ejecución de un nuevo tiro por cada equipo, repitiéndose hasta que un equipo aventaje al otro habiendo ejecutado ambos el mismo número de tiros.
Teamgeist, balón diseñado especialmente para Fútbol de 2006 la Copa Mundial de Fútbol 2006