Traduccion 1

  • November 2019
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Replicación del ADN Gabriela Azofeifa Vamos a repasar entonces un par de cositas que yo se que ustedes ya vieron en una de las clases al principio del curso por si acaso no se acuerdan ;en la clase de hoy vamos a estar muy centrados en estos dos términos que necesito que ustedes se acuerdan bien. Las diferencias entre las células procariotas y las células eucariotas, se acuerdan cual es la diferencia principal entre estos dos: compartimentalización y especialmente lo que es el núcleo, es lo que vamos a centrar hoy, efectivamente las eucariotas tienen diferente organelas y todo compartí mentalizado dentro de la células y especializado en la diferentes funciones cada organela, mientras que los procariotas solo tienen una membrana externa y todo incluido verdad ahí adentro, inclusive el ADN que es lo que vamos a estar hablando hoy, entonces vamos a tener el ADN disperso ahí, concentrado en una pequeña región que se le llama nucleoide pero realmente no esta delimitado por una membrana, entonces no se dice que es un núcleo verdadero, mientras que en las eucariotas si tenemos una membrana que protege al ADN. Ejemplos de Eucariotas quienes serian, ¿quienes tienen células eucariotas? Todos los animales, verdad, ustedes tienen células eucariotas cierto, todas las plantas, desde los hongos, las levaduras ya son células eucariotas, mientras que los procariotas estamos hablando en general de las bacterias y entonces hoy vamos a estar hablando de procesos que se dan en la biología molecular y que son diferentes para las procariotas y para los eucariotas entonces yo voy a estar enfatizando esto en esta diferencia y Por eso necesito que recuerden bien el termino, los ácidos nucleicos, ya ustedes recibieron una clase de esto y ya les hablaron de los componentes y de los ácidos nucleicos, entonces teníamos las bases nitrogenadas, ¿se acuerdan? verdad que son pequeños anillos que tienen carbonos y nitrógenos ahí intercalados y tenemos dos tipos ahí las purinas y las pimidinas y las diferencia es que las purinas van a tener dos anillos juntos, mientras que las pirimidinas tienen un solo anillo, y los ácidos nucleicos tienen otro componente que son los azucares, tendremos dos tipos de azucares que componen los ácidos nucleicos, y que hablamos de la ribosa y la desoxirribosa y ¿cual es la diferencia entre la ribosa y la desoxirribosa? El OH ¿en que posición? El carbono, entonces la diferencia va estar en el carbono 2, efectivamente por si empiezan a contar desde aquí, 1-2-3-4, tenemos un OH extra en el caso de la ribosa y aquí lo que tenemos es un hidrogeno, verdad, mientras que en la posición 3 ambos tienen un OH, eso tenemos que tenerlo muy claro ahora ok El azúcar, algunos azucares de los que se llaman Ribosa tienen OH, están en la posición 2 hasta la posición 3 mientras que las desoxirribosas solo están en la posición 3. ¿Cómo era que juntábamos esas tres moléculas, si ustedes ya estudiaron para tener una famosa molécula de ADN? Y estas estructuras que ustedes ya vieron, aquí estas que están en celeste serian los azucares, estos que están como en verde claro las bases nitrogenadas, y la molécula que une todo eso, verdad, los azucares y las bases nitrogenadas con otras bases nitrogenadas son los famosos fosfatos, si yo les hablara de los tres componentes principales de las estructuras químicas que componen el ADN: bases nitrogenadas fosfato y el azúcar , este que esta puesto aquí ¿que seria?, este tipo de azúcar, que seria ¿una ribosa o una desoxirribosa? Es desoxirribosa. Perfecto, entonces el azúcar va a enlazarse en carbono uno, con la base nitrogenada y aquí viene

un punto muy importante que necesitamos tener muy claro hoy, en el carbono 3 se puede unir un fosfato, pero también en el carbono 5, puede unirse otro fosfato. Ok Un azúcar de los ácidos nucleicos puede unirse en el carbono 3 a un fosfato y el carbono 5 puede unirse a un fosfato y ese fosfato a su vez se va a unir con el carbono 3 del siguiente azúcar y así es como se empiezan a afinar todas las bases nitrogenadas y podemos tener secuencias inmensas. Enlazar un fosfato con el azúcar una azúcar de vecino pero en la posición 3 y una azúcar en la posición 5. ¿Cómo se llaman esos enlaces? Entre el azúcar y el fosfato fosfodiéster y ¿los enlaces entre este azúcar y la base nitrogenada? Glucosídicos Y luego vamos a tener una cadena de estas verdad que tiene azucares y bases nitrogenadas frente a otra cadena, y eso es lo que hace las doble hebra del ADN, De forma que las bases nitrogenadas de una interactúan con las bases nitrogenadas de otra, en este tipo de enlaces que se llaman puentes de hidrógeno ok. Eso es lo que necesitamos saber para poder ver la clase de hoy. Que es lo importante aquí: Una vez que usted ponga cientos de nucleótidos juntos el ultimo nucleótido, digamos que este fuera el ultimo, va a tener un fosfato pegado en la posición 5 mientras que el ultimo que va a estar aquí ¿adonde va a estar pegado? En la posición 3 Entonces no es igual un extremo que otro, porque en un extremo el fosfato va a estar pegado en la posición 5, mientras que en el otro extremo va a estar pegado el fosfato esta pegado en la posición 3 y entonces decimos que la molécula de ADN tiene polaridad. No es lo mismo de un lado hacia el otro Y las hebras, una de las hebras del ADN va a juntarse con otra, con una hebra complementaria, pero que se dice antiparalelo o antisentido ¿Qué quiere decir eso? Que si aquí termino con 5 la siguiente es la molécula complementaria va a tener la posición 3 prima es donde va a tener el fosfato. Ok Y si aquí también terminaba con 3 , en la posición 3 era donde tenia el fosfato, en la complementaria la que va a tener es la posición 5 , entonces voy a dibujarlo por aquí, si tenemos una hebra de ADN, con todos sus azucares, el ultimo azúcar aquí va a tener la posición libre en el 3 prima, y el primer azúcar que va a estar aquí va ha ser el 5 prima y la cadena complementaria va a ser al revés antiparalelo si aquí tenia el 5 prima libre y aquí va a tener el 3 prima, aquí va a tener el 5 prima y ustedes saben que quiere decir esos 5 prima Es tener el fosfato pegado en esa posición o tenerlo en esta posición. Necesito que entiendan toda esta parte primero o que la tengan clara, yo se que ustedes ya saben. Y bueno lo otro que ustedes ya hablaron fueron las diferencias entre el ADN Y ARN. ¿Cuales son las diferencias entre ADN Y ARN? El ADN tiene una doble hélice y el ARN tiene simple banda. Las diferencias entre las bases nitrogenadas El azúcar en ARN es una ribosa y en el ADN una desoxirribosa

Cuando nos referimos al genoma de un organismo hablamos de todo el ADN que tenga su células de un organismo, no importa si codifica si no codifica, si le sirve no importa que sea, si es ancestral, si es muy evolucionado. Todo ADN de un organismo constituye su genoma. ¿Cual es la diferencia con un gen? Cual es la diferencia entre el genoma y el gen? El Gen es solo un pedazo de ese ADN que sirve para producir una proteína y vamos a centrar nuestra clase en ese proceso. Empezamos a hablar de un pedazo determinado desde aquí hasta aquí y tiene una tamaño determinado y no todos los genes son del mismo tamaño cuando hablamos de diferenciación génica ¿a qué nos referimos?, nos referimos más bien a que las diferentes células del cuerpo cada una expresa genes diferentes un ser de genes diferentes entonces las células de esos huesos expresan solo genes que le sean útiles a esos huesos mientras que las células del páncreas lo que están expresando es insulina pero sus células de huesos no van a expresar la insulina verdad, no tiene sentido Eso es lo que se llama diferenciación génica o diferenciación genética, cada célula se especializa en expresar ciertos tipos de genes que son los que le ayudan a cumplir su función. Ahora que quiere decir; que las células del páncreas no tienen la información para ser neuronas, sí, pero no la expresan la tienen silenciada. Todas las células tienen todo el genoma , todas las células tienen todo el ADN, la diferencia en que unas células expresan una parte y otras células expresan otra parte, hay una cosa que los biólogos moleculares le llaman el dogma central de la biología molecular y esta es la figura que esta en su libro. Finalmente aunque la biología no tiene dogmas pues este proceso se le llama así incorrectamente hablando, pero que quiere decir esto, quiere decir como se transmite la información en una célula que lo que tiene es un montón de adeninas, guaninas, timinas, y citosinas y como logran producir moléculas funcionales, moléculas como la insulina que ustedes ya han hablado en el curso muchas veces de la insulina y de todo lo que hace la insulina, verdad. Entonces como es que pasamos de tener adeninas, guaninas, timinas, y citocinas, ahí afiladas y eso me sirve para que al final yo tenga una molécula donde, con un montón de aminoácidos y súper compleja, secundaria y terciaria y todas esas cosas, y dominios proteicos que ya ustedes saben, como fluye esa información, entonces todas las células de ese sistema que fluye la información ha sido perpetuado en toda la existencia , eso es lo que lo hace ser sumamente exitoso e interesante, como es que las células desde las bacterias hasta , como las plantas y los animales todos usamos sistema de transmisión ¿Y en que se basa ese sistema , ese sistema se basa en 3 partes: La molécula del ADN, que es la que guarda la información y la que tiene las instrucciones para generar proteínas, que tienen moléculas activas y que tienen funciones, participan en el metabolismo y participan en muchos procesos y son estructurales entonces las moléculas que realmente hacen el trabajo, son las proteínas y la información que esta en el ADN. Ahora que pasa cuando uno compra un libro y lo usa todos los días como el libro de bioquímica de ustedes, que le pasa a ese libro, si yo compro el mismo libro que ustedes pero yo no estoy llevando el curso, entonces lo dejo guardado en el escritorio y a diferencia que ustedes compraron el libro y todos los días lo usan , al final del semestre como va a estar el libro de ella en comparación al mió, usado y gastado verdad, arrugado, doblado, cierto o no y espero que el de ustedes este muy usado y arrugado

Esto es lo que va a pasar con el ADN muchachos, si el ADN lo estamos leyendo y cada vez que necesitamos una proteína venimos y accedamos al ADN, y lo leemos y estamos chequeando las instrucciones para generar la proteína, finalmente ese ADN se nos puede dañar, y podría empezar a tener daños y mutaciones, a quebrarse y a romperse, entonces eso seria muy grave para las células, si ustedes el libro de bioquímica se les quema y se les despedaza no pasan el curso. Que esa no es la idea, por eso lo cuidan mucho. Por eso la célula tiene sistemas de información pero lo tiene protegido, solo lo consulta de vez en cuando y en vez de estar consultando el libro siempre sacamos, una fotocopia y la fotocopia es la que consultamos siempre y esa la rayamos y la dibujamos y le hacemos manchones y estudiamos con el café a la par y se riega el café y todo lo demás. Entonces saquemos una fotocopia y usamos la fotocopia y el libro queda bastante bien eso es lo que es el ARN, todas las células usan ese mecanismo, todas las células tienen su base de información en el ADN, sin embargo solo lo leen de vez en cuando y sacan una copia temporal, una copia temporal que es la del ARN , y este ARN es decir muchas veces lo leemos y lo estamos utilizando para producir proteínas, imaginasen si cada molécula de glucagón que ustedes necesitaran por cada una , tendrían que acceder al ADN , ese ADN se va a dañar. Entonces mejor hago una copia en versión ARN y cada vez que necesito glucagón, entonces si se me daña no importa ¿Por qué que pasa si se me daña el ARN? Vuelve a copiar el ADN Y la evolución ha creado un sistema tan inteligente y tan perfecto como este que custodia la información básica y por eso la tenemos protegido en histonas y no la consultamos tan a menudo, sino que consultamos la copia entonces al ARN tiene una vida media más corta que el ADN, es más activo químicamente. El famoso grupo OH en la posición dos hace que sea más reactivo. El Proceso Trascripción proceso en el que tomamos una molécula de ADN y lo convertimos en ARN. El proceso de hacer proteínas traducción. ¿Todo el ADN de mi célula del hígado se transcribe? No verdad. Lo mismo que hablamos antes solo los genes para que sea hígado se transcriben. Muchas de nuestras células se dividen las células de la piel, tracto gastrointestinal se dividen, cada vez que una célula se divide le tiene que heredar el paquete de genes a sus hijas si usted se va a dividir le tiene que dar el libro original de bioquímica a sus hijos, y las copias si se pueden deshacer de ellas. Entonces el proceso en el que una célula se divide y le tiene que dar un paquete de genes a sus hijas se llama replicación. Hoy vamos a empezar con replicación. Replicación Empezamos con una molécula de ADN original y vamos a terminar con una ADN también. Replicación y duplicación son sinónimos, depende del libro en el que lo lean. Que quiere decir el proceso de duplicación, generar una copia basados en una célula original, y eso es muy fácil. Porque es muy fácil, si yo les doy una secuencia de ADN ustedes me pueden sacar una copia, si verdad, porque? Por la complementariedad de las bases entonces quien es complementaria con quien adenina con timina y guanina con citosina, esas son las bases que son complementarias entonces es muy fácil generar una copia de una molécula; el ADN se duplica solo cuando la célula va a duplicarse. Las neuronas de nosotros como no se dividen más normalmente no hacen duplicación, mientras que las células de su piel constantemente se dividen, entonces tenemos unas bandas originales

que son estas que están en amarillo y vamos a generar una copia. Ahora esa copia podría seguir tres posibles modelos uno es el conservativo, que la duplicación fuera conservativa, que quiere decir que fuera conservativa que si este es el ADN original ( el azul) saquemos una copia (roja) ambas hebras del ADN van a ser nuevas y las hijas se dejan las copias, esa podría ser una opción. Modelo disperso que quiere decir el modelo disperso, si las originales fueran las azules yo voy a generar una copia en rojo en este caso, y ahora intercalo pedazos cambio partes de pronto aquí el pedazo rojo se , o paso al azul, y las mezclo y eso se llama un modelo disperso en una sola hebra hay pedazos azules y pedazos rojos, hay pedazos nuevos y pedazos viejos, pedazos que ya existían y otros que se acaban de sintetizar. La tercera opción es el modelo semi-conservativo y dice la verdad es que si tengo dos bandas originales, voy a sacar una copia de cada uno y en una célula dejo una original y una copia, y una original y una copia, y cual es el mejor modelo, y hace unos setenta años que no se sabía cual era los tres podrían ser viables, había que demostrar cual era. ¿ que ventajas tendría el modelo conservativo? In vivo y aquí lo puse el que ocurre es le semi-conservativo, cada célula hija hereda una hebra original y una hija. Cual ventaja o desventaja le observan al conservativo, por que la evolución no selecciono este, el problema es que si usted tiene solo unas nuevas y otras viejas como puede saber si existe error, no tiene la posibilidad de comparar y corregir. Y este otro disperso que dirían ustedes. Eso de estar cortando y pegando es muy riesgoso, empezar a pegar cosas incorrectas, de comerme una base de pronto. Entonces el que ocurre en la naturaleza es el in vivo. Hubo un experimento para averiguar esto, como en el 58 aún no se sabía cual era, unos señores desarrollaron un experimento que no lo voy a desarrollar en esta clase pero entonces si quiero que lo sepan, y voy a dejar una copia para que estudien el experimento. Ahora si vamos a empezar hablando del proceso de duplicación en procariotas luego vamos a ver las diferencias con los eucariotas ( no se escucha). Mientras el ADN está cerrado, la bases nitrogenadas estén con sus puentes de hidrogeno es difícil duplicar ese ADN, porque como hacemos para leer, necesitamos meternos en el medio y decir mira esto es una adenina, entonces el primer paso para duplicar el ADN es generar lo que se llama una horquilla de replicación, es abrir una pequeña burbuja en el ADN, ¿cuales enlaces se están rompiendo ahí? Puentes de hidrógeno verdad. Ojo que los enlaces fosfodiéster siguen intactos, los enlaces glucosídicos siguen intactos verdad, igual los azúcares están unidos a las bases nitrogenadas, lo único que se rompen son puentes de hidrógeno, y entonces se generan horquillas de replicación, eso es lo que ocurre, es el primer paso romper el ADN para que quede en simple banda y poder leer la información, y sacar una copia. Ahora resulta que ese ADN no se puede abrir en cualquier lugar, hay sitios específicos que se llaman orígenes de replicación (Ori). Un origen de replicación es una secuencia característica que le dice aquí es donde vamos a empezar la replicación, y por allá hay otros Ori y también inicia la replicación, dicen que los Ori son muy ricos en timinas y adeninas debido a que tienen solo dos puentes de hidrógeno, es más fácil abrir el ADN. Saben la diferencia entre horquilla de replicación y origen de replicación son dos cosas diferentes, el origen estamos hablando de la secuencia en sí, y la horquilla del espacio, la burbuja donde se va a dar la replicación. Que necesitamos para duplicar un ADN, lo primero que necesitamos es un ADN molde, no ocurre sin el molde, en la célula solo se peguen adeninas, citosinas, si son complementarias a una secuencia molde.

La enzima encargada de abrir esas horquillas de replicación de romper los puentes de hidrógeno que están aquí, de abrir espacios para que podamos leer, son las helicasas. Las helicasas que hacen, rompen los puentes de hidrógeno y permiten abrir la horquilla de replicación, donde empiezan las helicasas, en los Ori. Las helicasa van a separar la doble hélice, la helicasa es hexamérica tiene seis dominios, y en los seis dominios se introducen o organizan alrededor de sto , entonces lo podríamos ver así, las helicasas son bastante rápidas, podrían abrir hasta mil pares de bases. Entonces lo primero que necesitamos en la lista fue un ADN molde, lo otro que estamos necesitando para usar son las helicasas, las helicasa son las que abren. Siguiente. El tercer requisito que necesitamos para replicar el ADN son unas proteínas que llamamos ssb, proteínas ssb se les da el nombre por sus siglas en ingles, proteínas de unión a ADN en simple banda, y se les abrevia como ssb, estas proteínas van detrás de la helicasas, una vez que la helicas va abriendo aquí, todos estos pedazos que quedan en simple banda tienden a cerrarse, ayudan a las helicasa ¿ por qué? Si las helicasas irían abriendo el ADN y este como está en simple banda tendería a doblarse sobre si mismo y tratar de formar algunos puentes de hidrógeno, entonces la proteína ssb conforme la helicasa va abriendo este enlace, se van pegando al ADN que está en simple banda y ayudan a mantener este ADN estirado. Que más necesitamos, si usted va a sintetizar una cadena de ADN nueva va a necesitar nucleótidos libres (dexosi nucleótidos). La que necesitamos ahora es la enzima más importante es la ADN polimerasa. La ADN polimerasa es la que realmente hace todo el trabajo, tiene una especie de canal donde introduce la molécula de ADN y una vez que están separadas las bandas en simple hélice lee la banda que está es simple hélice y se fija y dice mira tiene una adenina y toma una timina y se la pega a la nueva cadena que va creciendo. El trabajo de la polimerasa es localizar el nucleótido adecuado y pegárselo ala cadena que va creciendo. Ahora ¿por qué la polimerasa es una proteína tan importante? Porque si alguien se va a equivocar son la helicasas, no sería tan dramático, verdad; quien es la que se puede equivocar y si sería algo grave, la polimerasa. Es por eso que la polimerasa tiene la función más crítica, verdad; ella es la que se puede equivocar, hay dos opciones que ella se equivoque al tomar un nucleótido que no le corresponda, entonces esta enzima es muy compleja y trata de garantizarse que su trabajo va a ser perfecto. Si las polimerasas de nosotros comenzaran a equivocarse muy a menudo significaría que sus células y sus células empezarían a mostrar mutaciones, hay familias que tienen polimerasas que tienden a equivocarse un poquito más a menudo que otras y por eso son familias más susceptibles a padecer cáncer, es por eso que de lo que dependen es d una polimerasa que se equivoco más veces y generó más mutaciones y hizo a esa célula que empezara a duplicarse anormalmente. Es por eso que hay diferentes calidades de polimerasas ( no se entiende). Entonces la polimerasa para garantizar no equivocarse lo primero que hace es pegar el nucleótido y lo segundo que hace es que verifica que lo que haya pegado sea lo correcto. Entonces eso se llama mecanismo de corrección de prueba, antes de hablar de esto. La polimerasa siempre sintetiza en dirección de cinco prima a tres prima, que quiero decir con esto, que la primera base que pegue, que ella ponga aquí va tener un azúcar pegado y va a pegar un montón más y el ultimo azúcar que ella ponga con su respectiva base nitrogenada va a tener el extremo tres prima libre., y si yo pregunto como lee la

polimerasa, si ella sintetiza de cinco a tres quiere decir que lo que está leyendo, usando de molde es de tres a cinco. Esto tiene que tenerlo muy claro, ella sintetiza de cinco a tres pero lee de tres a cinco, entonces depende de lo que le este preguntando en el examen, verdad. Si la polimerasa sintetiza de cinco a tres lee de tres a cinco, depende de lo que les este preguntando. Entonces la polimerasa sintetizó el primer nucleótido que tenía el extremo cinco libre luego el segundo, tercero…, y el que acaba de poner tiene el extremo tres prima libre, de pronto la polimerasa se equivoca, y mete una citosina que tiene un asterisco, que quiere decir una citosina que estaba mal, que debería a ver puesto hay una timina verdad, entonces la polimerasa se equivocó, pero yo les dije la polimerasa no solo es muy selectiva, sino que pone el nucleótido y cuando lo pone se fija para ver si el que puso lo hizo bien, entonces eso es lo que se llama corrección de prueba, que hace la corrección de prueba, fijarse en el nucleótido anterior y si esta mal puesto, la polimerasa lo detecta y lo elimina, y trae el correcto y lo pega. Entonces se dice que la corrección de prueba es en dirección tres cinco, ¿por qué tres cinco? Ella va sintetizando cinco tres pero cuando quiere quitar el anterior tiene que devolverse un paso, así que es tres cinco. La polimerasa siempre hace eso nucleótido que pega nucleótido que revisa, si esta bien continúa. ( alguien pregunta no se entiende) La polimerasa tiene subunidades, tiene una que polimerasa, y otra que se llama exonucleasa, que hace corta, entonces es la misma polimerasa hablamos de una holoenzima, tiene partes especializadas, una pega otra corta. Corta en tres cinco ya habíamos dicho la corrección de prueba, cuando hablo de polimerasa sintetizo, cuando hablo de exonucleasa hablo de cortar. ( no se entiende) Todas las polimerasas sintetizan de cinco a tres, actividad exonucleasa cinco a tres eso que quiere decir que quita algo que me este estorbando, solo la tiene la polimerasa I. La polimerasa tres que características tenía, no podía empezar sola, iba de cinco a tres, si puede revisar hacia tres prima, ella solita la podemos dividir en subunidades, pero no lo vamos a hacer. Hay una subunidad que se llama complejo gamma que le ayuda a la polimerasa para que una vez que está unido al ADN no se despegue, eso se dice que mejora la procesividad. Les dije entonces, como lo vimos en el cuadro que todas las polimerasa sintetizan de cinco a tres, ninguna que sintetizara de tres a cinco, cierto; entonces tenemos un problema, porque una de mis hebras sintetiza de cinco a tres pero la otra yo necesitaría un extremo tres prima, cual sería una solución tener una polimerasa que sintetice de tres a cinco, pero no la tenemos, entonces necesitamos otra solución, que hace la naturaleza sintetiza de esta forma, una polimerasa se une aquí, luego de que una helicasa rompe los puentes de hidrógeno, se une aquí al extremo tres prima y comienza a sintetizar, muy bien, esa no tiene problema, la otra banda que me proporciona un extremo cinco prima no permite la síntesis, la polimerasa va al revés, esta banda se llama la banda rezagada, se sintetiza por partes, la otra que si se puede sintetizar en un solo movimiento se le llama la cadena líder. La cadena rezagada se va a sintetizar por pedazos, siempre siguiendo la dirección cinco tres, entonces hacia acá al revés. Cada uno de esos pedacitos de la cadena rezagada se llaman fragmentos de okasaki, porque los descubrió un señor okasaki. ( varias personas preguntan). La polimerasa no puede empezar sola, necesita que aquí halla un azúcar, que le de un extremo tres prima, luego puede sintetizar, que quiero decir con esto que la polimerasa no puede poner el primer nucleótido, el segundo, tercero si pero el primero no. Cómo hace la célula para solucionar esto, la célula tiene una enzima diferente llamada primasa, la primasa si puede poner el primer nucleótido. Entonces está el ADN en

simple banda ya que las helicasas lo abrieron y viene la primasa y pega el primer nucleótido, ella si puede, cual es el inconveniente que tiene la primasa que lo que sintetiza es ARN, quiere decir que los azúcares que está poniendo aquí tienen un OH aquí. El defecto que tiene la primasa, la primas es muy buena porque puede sintetizar el primer nucleótido, pero es ARN, tenemos un pedazo de ARN, pero viene la polimerasa y comienza a sintetizar. Entonces que pasa en los fragmento de okasaki que teniamos aquí, cada fragmento de okasaki necesito de un extremo entonces la cadena rezagada tiene muchos pedacitos de ARN ahí pegados, uno por cada fragmento de okasaki, mientras que la cadena líder solo el primero. Vean lo que necesitamos hacer ahora, ya tenemos un ADN duplicado, tenemos una banda original y una copia el problema que tengo ahora es que ya tengo la cadena duplicada pero con unos pedacillos de ARN, que es lo que debería hacer, cambiar esos pedazos de ARN a ADN necesito a alguien que pueda sintetizar y quitar esos nucleótidos, quién será, una polimerasa para que me ponga los pedazos nuevos y además que actividad exonucleasa, es decir que quite, y que quite para que lado, para cinco verdad. Quien tenía eso, se acuerdan que yo les dije que algunas polimerasas tenían las tres actividades, la polimerasa I, que hace la polimerasa, primero vino la primasa y sintetizó ARN, vino la polimerasa tres tomo ese extremo tres prima y sintetizo de ahí en adelante, tenemos ese ARN que está estorbando, viene está polimerasa, que características tenía, no puede comenzar a sintetizar sola, importa? Aquí no ella quita los pedazos de ARN y a la vez va sintetizando los que si son ADN, así corrige el error. Además tiene actividad de prueba el pedacito que está corrigiendo lo revisa. A veces se dice que la está polimerasa tiene todas las actividades, y que el dominio que quita los que está adelante es una ARNasa. La polimerasa corrige los pedazos de ARN pero todavía no hemos unido los fragmentos de okasaki, por qué? Vino la priamasa y sintetizó 5 nucleotidos de ARN luego la polimerasa sintetizo un montón ( fragmentos de okasaki) cuál es le problema? Que el primero que sintetizó la primasa y el último que sintetizó la polimerasa no están unidos. Que molécula une estos dos, que falta un fosfato porque estos pedazos fueron sintetizados por moléculas diferentes, entonces no hay ese fosfato, no importa por ahora. Entonces viene la polimerasa I y corrige ( no se entiende). Cual es el problema, un fosfato por ahí, viene una enzima más la ligasa, usa una molécula de ATP, y pone un fosfato que hacia falta ahí, ahora tenemos una cadena continua, esa es la ligasa. Se gasta un ATP por cada fosfato. El fosfato solito no reacciona con el OH necesita el ATP. Unió el extremo tres prima del okasaki con el cinco, topoisomerasa son las que faltan. La función de la topoisomerasa no es en la burbuja de replicación, antes o después donde el ADN está en doble banda, aún no han llegado las helicasas, que es lo que pasa entonces si usted tiene una hélice y abre una burbuja que es lo que va a pasar en los lados, se empieza a concentrar tensión , y los cromosomas son inmensos verdad, y no podemos abrir un cromosoma del principio hasta el final, sino lo que se abre son pequeños pedazos, entonces va a generar tensión siempre a los lados, las moléculas topoisomerasas se paran en esos lados que todavía están en doble banda y generan pequeños cortes una topoisomerasa ataca aquí, y genera un pequeño corte, ese pequeño corte permite que el ADN gire sobre si mismo, y que una de las bandas libere tensión. Entonces la función de las topoisomerasas es liberar tensión en las bandas que todavía están en doble banda, a los lados de la horquilla de replicación.

Se tiene que duplicar una copia completa de ADN, aunque sea una célula del páncreas y no vaya a necesitar otra información, igual necesitamos un set completo. Resumimos rápidamente, hablamos de horquillas de replicación, primero hablamos de un Ori que es una secuencia característica en el ADN, se abre la burbuja, abrimos la horquilla en un Ori, quien abre la horquilla, las helicasas verdad; van rompiendo puentes de hidrógeno, detrás de las helicasas vienen las proteínas ssb, que se pegan en las partecitas que están en simple banda, después que las proteínas ssb actuaron, la primasa viene, en la cadena rezagada pone varios pedazos de ARN ese es el problema, y un pequeño pedazo en la cadena líder, después actua la polimerasa III, va ha pegarse en el extremo tres prima y sintetiza todo lo que sigue hasta toparse con un …….., después que la polimerasa tres ya sintetizó quien sigue, la polimerasa I, y que hace, quita ARN y ademas corrige y sintetiza un verdadero ADN, cual es el problema que tenemos ahora tenemos uno huecos, quien los soluciona, la ligasa, habian otras proteínas más que cortan unas partes y desenrollan, son las topoisomerasas. La cadena líder va a ir sintetizando de cinco a tres y la otra también, entonces las polimerasas se van a ir alejando, pero eso no pasa en la naturaleza, van juntas, entonces lo que hace la célula, la cadena rezagada la dobla, entonces la polimerasa va sintetizando en cinco tres pero, así mantiene el orden.

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