Terms Partie A Chap.1 Tp1

SVT TermS PARTIE A Chap.1

TP n°1 : Établir des parentés à partir de données moléculaires Problème: Comment utiliser les données moléculaires pour construire un arbre phylogénétique? Utiliser la fiche méthode phylogène, pour chacune des activités ci-dessous.

Activité 1. Molécules homologues •Choisir la collection « vertébré lycée ». Ouvrir un fichier de séquences. Choisir le fichier « HBA-vertébrés.aln » •Sélectionner les séquences suivantes : Homme, chat, pigeon, crocodile, Thon, Grenouille. •Dans le tableau sont répertoriées les séquences d'acides aminés de la protéine d'Hémoglobine A chez les vertébrés choisis. Indiquer comment apparaissent les différences de séquence en acide aminés, et rappeler ce qu'est un acide aminé. •A quoi correspondent les différences dans les séquences? •Les molécules étudiées sont des molécules homologues. Proposer une définition. •En déduire le rôle de l'étude des molécules homologues sur la parenté des êtres vivants.

2. Matrice des distances •Réaliser la matrice des distances et recopier les résultats obtenus (option, choisir pourcentage de différence). Proposer une définition pour « matrice des distances ». •Indiquer les êtres vivants ayant une séquence la plus proche et ceux ayant une séquence la plus éloignée. •Que peut-on en déduire concernant la molécule homologue possédée par l'ancêtre commun?

3. Arbre de parenté •Réaliser l'arbre de parenté et recopier l'arbre obtenu. •Faire la même chose mais pour la molécule HBB (hémoglobine béta), à partir du fichier

Capacités

Barème

Utilisation maîtrisée des fonctionnalités d'un logiciel /1 /1 /1 /1

Utilisation maîtrisée des fonctionnalités d'un logiciel

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Utilisation maîtrisée des fonctionnalités d'un logiciel

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« HBB-vertébré.aln ». Recopier la matrice des distances et l'arbre obtenu et analyser les résultats. •Sachant que les séquences obtenues sont partielles, et que celles-ci sont deux chaines de la macro-molécule d'hémoglobine, proposer une hypothèse pour expliquer la différence observée.

4. Comparaison avec des données anatomiques et morphologiques •Construire une matrice de caractères avec les mêmes vertébrés et les caractères suivants: amnios, crâne et vertèbres, membre basal, placenta, plumes et la compléter. •Polariser les états des caractères. Pour choisir l'extra-groupe, choisir le vertébré possédant le moins d'innovation évolutives. •Établir des parentés, en créant l'arbre de parenté.

•Imprimer « l'arbre à colorier ». Légender l'arbre. Comparer l'arbre obtenu avec celui des données moléculaires. •Conclure sur l'intérêt des données moléculaires pour la construction d'arbres phylogénétique et leur étude.

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Utilisation maîtrisée des fonctionnalités d'un logiciel

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Cohérence ou exactitude du résultat

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Traduction graphique des informations /2