RETRO VIRUS Retrovirus ditemukan ketika mempelajari penyebab jenis tumor tertentu di ayam, kucing, dan tikus, dan virus RNA adalah virus yang menyebabkan tumor. Pada tahun 1970 ketika David Baltimore, Howard Temin, dan Satoshi Mizutani menemukan sebuah polimerase DNA yang tergantung pada RNA yaitu transkrip terbalik, yang memungkinkan virus ini untuk menyalin RNA ke dalam DNA. Transkripsi balik bertanggung jawab untuk mengisi genom dengan banyak jenis rangkaian DNA, termasuk retrovirus. Terdapat berbagai jenis retro virus yang telah diidentifikasi dan diisolasi, dan yang paling terkenal adalah HIV yang menyebabkan kekebalan tubuh mengalami sindrom defisiensi atau AIDS. AIDS ditularkan dari satu orang ke orang lain melalui cairan tubuh seperti itu sebagai darah atau air mani yang telah terkontaminasi dengan HIV. Suatu penelitian melakukan penelitian mengenai siklus hidup HIV Virus bola memasuki sel target dengan berinteraksi dengan protein reseptor spesifik atau reseptor CD4, yaitu terletak di permukaan sel. Interaksi ini ditengahi oleh glikoprotein (protein gula yang telah dilampirkan) disebut gp120, yang tertanam di dalam lipid membran yang mengelilingi partikel virus. Setelah gp120 "berada" dengan CD4 reseptor, membran virus dan seluler berfusi dan partikel virus diterima sel. Di dalam sel, membran lipid dan mantel protein yang mengelilingi partikel virus dihapus, dan bahan-bahan di dalam inti virus dilepaskan ke dalam sitoplasma sel. Inti sel mengandung dua molekul RNA untai tunggal yang identik dan sejumlah kecil protein yang memfasilitasi replikasi genom, termasuk dua molekul dari virus transkrip terbalik, satu terikat pada masing-masing untai RNA virus, pada saat itu RNA untai tunggal akan menjadi DNA. Double strand dari molekul DNA dimasukkan pada posisi acak dalam kromosom sel yang terinfeksi, akibatnya genom memenuhi sel dengan banyak salinan virus genom. Salinan ini kemudian ditranskripsi oleh RNA polimerase biasa sel untuk menghasilkan sejumlah besar RNA virus, yang berfungsi untuk mengarahkan sintesis virus protein dan juga menyediakan RNA genomik untuk perakitan partikel virus baru. Partikel diekstrusi dari sel dengan proses budding melalui sel selaput. Partikel yang diekstrusi kemudian dapat menginfeksi sel lain dengan berinteraksi dengan CD4 reseptor pada permukaannya. Dari hal tersebut HIV materi genetik direplikasi dan disebarluaskan melalui populasi sel imun yang rentan. Genom HIV, panjangnya sedikit lebih dari 10 kilobase, mengandung beberapa gen. Tiga dari gen-gen ini, dinyatakan gag, pol, dan env, ditemukan di semua retrovirus lainnya. Gen gag mengkode protein dari partikel virus; gen pol mengkodekan sebaliknya transkriptase dan enzim lain yang disebut integrase, yang mengkatalisis penyisipan Bentuk DNA dari genom HIV ke dalam kromosom sel inang dan gen env mengkodekan glikoprotein yang tertanam dalam amplop lipid virus. Retrovirus terintegrasi dari berbagai jenis genom vertebrata. Karena retrovirus ini direplikasi bersama dengan sisa DNA, mereka ditransmisikan ke anak perempuan sel selama pembelahan, dan jika retrovirus terintegrasi dalam sel-sel kuman, mereka juga diteruskan ke generasi berikutnya melalui gamet. Ahli genetika panggilan urutan DNA yang diturunkan yang diturunkan dari transkripsi terbalik dan integrasi genom virus endogen retrovirus. Untuk Paling sebagian, urutan ini telah kehilangan kemampuan mereka untuk menghasilkan infeksi virus partikel; karena itu, mereka adalah sisa-sisa virus kuno yang tidak berbahaya infeksi. HIV bukan
retrovirus endogen, tetapi jika itu harus kehilangan nya letal potensial dan ditransmisikan dalam bentuk terintegrasi melalui kuman baris, itu bisa menjadi satu. UNSUR RETROVIRUS Unsur-unsur retrovirus ditemukan pada eukariota yang berbeda, termasuk ragi, tanaman, dan hewan. Meskipun perbedaan ukuran dan nukleotida urutan, mereka semua memiliki struktur dasar yang sama: wilayah pengkodean pusat diapit dengan pengulangan terminal yang panjang, atau LTR. Karena dari LTR karakteristik mereka, elemen retroviruslike kadang-kadang bernama LTR retrotransposon. Daerah pengkodean elemen retrovirus berisi gen dengan jumlah yang kecil, biasanya hanya dua. Gen akan tetapi retrovirus memiliki gen ketiga. Protein pol memainkan peran penting dalam proses transposisi.Salah satu elemen mirip retrovirus yang paling banyak dipelajari adalah transposon Ty1 dari ragi Saccharomyces cerevisiae. Elemen ini tentang 5.9 pasangan kilobase panjang; LTR-nya sekitar 340 pasangan basa, dan menciptakan duplikasi situs target 5-bp pada saat penyisipan ke dalam kromosom. Sebagian besar strain ragi memiliki sekitar 35 salinan Ty1 elemen dalam genom. Ty1 elemen hanya memiliki dua gen, TyA dan TyB. Transposisi Telements melibatkan transkripsi terbalik RNA. Setelah RNA disintesis dari Ty1 DNA, transkriptase terbalik yang dikodekan oleh itu TyB gen menggunakannya sebagai templat untuk membuat DNA untai ganda, cakap dalam partikel seperti virus. Kemudian DNA yang baru disintesis dipindahkan ke nukleus dan dimasukkan di suatu tempat dalam genom, menciptakan elemen Ty1 baru. Unsur-unsur mirip retrovirus juga telah ditemukan di Drosophila. Salah satu yang diidentifikasi disebut copia, dinamakan demikian karena menghasilkan jumlah berlebihan RNA. Elemen copia secara struktural mirip dengan elemen ragi Ty1. Gipsi juga termasuk retrotransposon Drosophila lain, yang memiliki ukuran lebih besar daripada copia karena mengandung gen yang mirip dengan gen env dari retrovirus. Keduanya copia dan unsur-unsur gipsi membentuk partikel mirip virus di dalam sel Drosophila namun hanya partikel yang mengandung RNA gipsi yang dapat bergerak melintasi membran sel, hal tersebut dikarena mereka juga mengandung produk gen env gypsy. Elemen gipsi Oleh karena itu tampaknya menjadi retrovirus asli.. SINTESIS PROTEIN Sebagian besar gen menggunakan efeknya pada fenotip melalui protein yang memiliki struktur yang spesifik. Protein tersusun dari beberapa polypeptide, setiap polypeptide terdiri dari rantai yang panjang yang tersusun dari asam amino yang akan menjadi ikatan peptide. Peptida tersusun dari lebih dua asam amino. Urutan asam amino pada polipeptida disebut dengan struktur primer. Struktur kedua dari polypeptide mengacu pada interrelationship dari segmen asam amino. Pada hemoglobin terdapat perotein yan kompleks dan terdiri dari empat polupeptida. Pada sintesis protein terapat dogma sentral yang akan mentransfer informasi genetik dari DNA menuju DNA pada saat transmisi dari generasi ke generasi dan dari DNA menuju RNA protein ketika pembentukan sifat fenotip makhluk hidup. Transfer informasi genetic dari DNA menuju RNA untuk protein ataupun sintesis protein. Transkripsi adalah ransfer informasi genetic dari DNA menuju RNA. Dan translasi adalah transfer informasi dari RNA menuju protein.
RETRO VIRUS, SITESIS PROTEIN, DAN TRANSKRIPSI Untuk memenuhi tugas matakuliah Genetika 1 Diampu oleh Prof. Dr. Duran Corebima Aloysius, M.Pd. Disajikan pada 6 Februari 2019
Disajikan oleh: Rahmat Aditya Kusaini
(170341615055)
Wachidah Hayuana
(170341615105)
UNIVERSITAS NEGERI MALANG FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM JURUSAN BIOLOGI 2019