La organización del torneo quedó a cargo de un comité (Organisationskomitee, abreviado OK) presidido por Franz Beckenbauer. Horst Schmidt, con el cargo de primer vicepresidente , quedó a cargo de los asuntos organizativos, desde financiamiento hasta transporte y administración. Wolfgang Niersbach, segundo vicepresidente, quedó como jefe de prensa y encargado de publicidada e información. Theo Zwanziger administró los asuntos legales y los recursos humanos, mientras los asuntos de cultura y arte quedaron a cargo de Fedor Radmann. El Comité Organizador quedó conformado por 14 miembros y un comité supervisor de 10. A este grupo se sumaron los embajadores deportivos: Jürgen Klinsmann, Oliver Bierhoff, Karl-Heinz Rummenigge y Rudi Völler. Posteriormente, 14 nuevos embajadores se sumaron para representar a las diferentes ciudades sedes.
Para este torneo, 12 ciudades fueron elegidas sedes del torneo de un total de 20 ciudades postulantes, quedando descartadas algunas como Bremen, Düsseldorf, Mönchengladbach, Bochum y Duisburgo. En las ciudades seleccionadas, los estadios comenzaron a prepararse poco tiempo después de la elección de Alemania para albergar el estadio. Mientras algunos se sometieron a arreglos menores, muchos debieron ser completamente restaurados y algunos fueron construidos especialmente para el torneo. Para el evento, cada estadio remodelado necesitó una inversión que varió entre los 48 y 280 millones de euros. Además, más de 1.380 millones de euros fueron gastados para los estadios completamente nuevos. El costo superó ampliamente lo gastado durante el torneo de 1974, en el que se gastaron apenas 242 millones de marcos (aproximadamente 121 millones de euros) para la habilitación de todos los centros deportivos. Muchos estadios tienen en la actualidad nombres de empresas auspiciadoras, como el Allianz Arena, uno de los estadios nuevos y que albergará el primer partido del torneo. Sin embargo, la FIFA prohíbe la utilización de este tipo de nombres, por lo que la mayoría de los estadios se llamarán "Estadio de la Copa Mundial" durante la realización del torneo. Estos recintos aparecen indicados en cursiva en la tabla siguiente.
Ciudad
Estadio
Capacidad
Berlín
Olympiastadion
76.176
Colonia
RheinEnergieStadion
46.120
Dortmund
Signal Iduna Park
66.981
Fráncfort
Commerzbank-Arena
48.132
Gelsenkirchen
Veltins-Arena
53.804
Hamburgo
AOL Arena
51.055
Hanóver
AWD-Arena
44.652
Kaiserslautern
Fritz-Walter-Stadion
41.170
Leipzig
Zentralstadion
44.199
Múnich
Allianz Arena
66.016
Núremberg
easyCredit-Stadion
41.926
Stuttgart
Gottlieb-Daimler-Stadion
54.267
Cada selección se establece durante su participación en el torneo en un "cuartel", es decir, un conjunto de establecimientos deportivos para su alojamiento y entrenamiento, los que en general se ubican en pequeñas localidades y corresponden a exclusivos recintos de lujo. En esta oportunidad, sólo los combinados de Alemania y Ucrania prefirieron hospedarse en los territorios de la antigua Alemania Oriental, mientras las 30 selecciones restantes lo hicieron en el sector occidental. En tanto, los estados de Schleswig - Holstein y del Sarre, no albergaron ningún equipo. Previamente, el Comité Organizador recibió cerca de 300 propuestas de diferentes hoteles y recintos deportivos. De éstos, 110 pasaron los requisitos mínimos y fueron ofrecidos a las selecciones.
Equipo
Ciudad
Estado
Equipo
Ciudad
Estado
Alemania
Berlín
Berlín
Angola
Celle
Arabia Saudí
Bad Nauheim
Hesse
Argentina
Herzogenaura Baviera ch
Australia
Zweiflingen
Brasil
Königstein
Hesse
Corea del Sur
Bergisch Gladbach
Costa de Marfil
Niederkassel
Renania N Westfalia
Costa Rica
Walldorf
Croacia
Bad Brückenau
Baviera
Ecuador
Bad Kissingen
Baviera
España
Kamen
Renania N.Westfalia
Hamburgo
Hamburgo
Francia
Aerzen
Baja Sajonia
Ghana
Würzburg
Baviera
Inglaterra
Bühl
Irán
Friedrichshafen
Italia
Duisburgo
Japón
Bonn
México
Göttingen
Baja Sajonia
Países Bajos
Hinterzarten
Paraguay
Oberhaching
Baviera
Polonia
Barsinghausen
Baja Sajonia
Portugal
Marienfeld
Rep. Checa
Westerburg
Renania-Palatinado
Serbia y Mont.
Billerbeck
Suecia
Bremen
Bremen
Togo
Wangen im Allgäu
BadenWürttemberg
Túnez
Schweinfurt
Baviera
Estados Unidos
BadenWürttemberg Renania N Westfalia BadenWürttemberg
BadenWürttemberg Renania N.Westfalia BadenWürttemberg
Baja Sajonia
BadenWürttemberg Renania N.Westfalia
Renania N.Westfalia Renania N.Westfalia
Suiza
Bad Bertrich
Renania-Palatinado
Trinidad y Tobago
Rotemburgo
Baja Sajonia
Potsdam
Brandemburgo
Ucrania