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실험 데이터 포샵질, 이렇게 하면 데이터 조작

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실험 데이터 포샵질, 이렇게 하면 데이터 조작 2009-02-18 02:45:25

현미경 사진, 젤 사진 등의 실험 데이터를 완전히 디지털로 처리하고 간단히 프로세싱할 수 있다는 것은 반대로 포토샵 등의 프로그램을 이용하여 간단히 조작된 실험 데이터가 만들어질 수도 있다는 위험도 가져왔다. 그렇다면 실험 데이터를 포토샵으로 건드리는 것은 무조건 안되는 것일까? 간단한 컨트라스 트, 브라이트니스 조정도 안되는 건가? 사이즈 마커와 샘플 사이에 잘못 빈 레 인을 남겨두었는데 이것을 잘라내는 것도 데이터 조작인가? 아니면 웨스턴 블 랏 결과에 찍힌 약간의 잡티 슥슥지우기는? 이쪽 업계에서 꽤 저명한 저널인 Journal of Cell Biology (JCB) 에서는 이러 한 디지털 데이터 사진에서 흔히 발견되는 ’부적절한 후처리’ 의 사례를 제공하 고 있다. 실험 데이터를 논문화할때 혹시라도 이러한 실수를 해서 데이터 조작 이라는 오명을 뒤집어쓰고 싶지 않다면 아래 소개한 주의사항들을 꼭 명심하는 것이 좋을 듯 하다. 물론 서로 다른 저널에서 다른 투고기준을 가지고 있긴 하지 만 비교적 Strict 한 JCB의 기준을 충실히 따르면 대개의 저널에서 큰 문제가 없 을 듯 하다.

1. 밴드 덧붙이기 또는 지우기

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너무나 당연해서 따로 설명할 필요도 없는 문제이다. 패널 A는 있던 밴드를 지운 결과고, 패널 B는 없던 밴드를 추가한 결과이다. "젤 로딩을 잘못해서 그 렇구요 이게 원래 맞는 거예요" 내지는 "뭐 중요하지 않은 마이너 밴드인데 좀 지워도 되지 않나효" 하는 생각하시는 분이라면 저기 실험실 구석에 가서 옐로 우팁통에 머리박고 있을 것.

2. 로딩 콘트롤 재활용

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. 웨스턴 등에서 단백질 로딩한 양이 동일하다는 것을 보여주기 위한 콘트롤 (Actin 등) 을 위와 같이 재활용(?) 하는 경우가 있는데 이 역시 어이없는 데 이터 조작행위이다. (즉, 하지 않은 실험을 한 것 처럼 꾸미는) 참고로 얼마 전 에 9년 전에 퍼블리시된 Cell 페이퍼 하나가 로딩 콘트롤 사진 중복의 이유로 Retraction 된 적이 있다. 3. 일부 레인만 콘트라스트 조정

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패널 A처럼 젤 사진에서 특정한 레인에 대해서만 컨트라스트 조절을 해서 전체 적인 양 비교를 고치는 행위는 데이터 조작행위다. JCB는 데이터 사진의 일부 에 대해서만 컨트라스트나 브라이트니스를 조절하는 것을 금지하고 있다. 용 납되는 것은 데이터 사진 전체에 대해서 컨트라스트나 브라이트니스를 적용하 는 것. 그러나 이것도 패널 B 의 3번처럼 너무 심하게 하여 있던 마이너 밴드를 사라지게 하는 정도로 하는 것은 곤란하다. 1번에서 2번 정도의 보정은 용납된 다고 함.

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4. 동일 젤 내에서 잘라내기로 이동

- 젤 사진에서 밴드만 잘라서 다른 곳으로 이동시키는 것은 (설령 크기를 변 하게 하지 않더라도) 안됨. - 동일한 젤에서 레인 전체를 잘라서 순서를 재배치하는 것은 용납됨. 그러나 그 때도 레인 사이에 여백을 남겨두어서 ’잘라서 이동된 것임’ 이라는 표시를 할 수 있어야 한다. - 여러 장의 젤 (혹은 웨스턴) 에서 각각의 레인을 잘라서 재구성한 후 밴드의 양 을 비교하는 그림을 만드는 것은 안됨. (하나는 5초 익스포즈하고 다른 하나는 10분 익스포즈한 웨스턴 결과를 비교한다고 생각해 보시길) 허용되는 것은 하 나의 젤에 로딩한 것을 재배열하는 것임. 저 밑에 예를 든 사이언스 논문을 잘 찾아보면 이것저것 서로 백그라운드 레벨이 틀린 웨스턴 블랏을 조합한 데이터 가 있는데, 저런 것은 안되는 겁니다.

5. Cloned Brush 등으로 잡티제거

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웨스턴 등을 하다보면 메이저 밴드 이외에 미세한 잡밴드나 노이즈 등이 있 어서 이를 지우고 싶다는 충동이 들 때가 있다. 이럴 때 악용되는 툴로써 Cloned Brush 같은 것이 있는데, 하지마셈. 그런 것은 여(남)친 사진 찍어서 발견한 얼

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굴의 주근깨 지울때 쓰라고 만든 툴입니다요. (저 밑에 밴드를 걍 하얀색 지우개 툴로 지운 작자는 많이 안습이다. 포토샵 의 기본이 안 되어있음)

5. 강조하기 위한 덧칠

위의 EM사진에서 immunogold particle 이 위치한 곳을 강조하기 위해서 particle 을 직접 검은색으로 칠했는데 이렇게 하면 안되고 그냥 화살표 같은 것으 로 표시해야 한다.

6. Contrast+Brightness (O) / Level+Curve (X) 포토샵에서 Contrast 나 Brightness 등으로 조절을 하는 것은 모든 명도범위의 픽셀에 대해서 균일한 정도의 변화를 주기 때문에 무방하지만,포토샵의 Level 이나 Curve 등의 툴을 이용하여 특정한 밝기의 픽셀은 내버려두고 특정한 영역 의 밝기를 가진 픽셀만을 조절하는 것은 피하라는 이야기. 7 | http://medialab.egloos.com

그 외의 기타등등은 원본 논문을 읽어보시길 바라며.. 끝으로 논문 데이터에 손을 잘못 대면 어떻게 되는지는 잘 아시겠지만 다시 한번 상기하는 의미에서 다음과 같이

’포샵원천기술논문조작330조국익손실크리 ㅋㅋㅋ’ 로 세계방방곡곡에서 영 원히 놀림받기 싫으면...

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펴낸날 : 2009. 02. 18. 지은이 : Newbie 펴낸곳 : 이글루스 이 책은 지은이와 egloos.com의 동의 없는 무단 전재 및 복제를 금합니다. published by egloos.com in Seoul, Korea