Enzimas: J. Jorge Huamán Saavedra Doctor En Medicina, Magister En Bioquímica 2019

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ENZIMAS J. Jorge Huamán Saavedra Doctor en Medicina, Magister en Bioquímica 2019

Bioquímica Médica. J.Huamán S

1

Contenido Enzimas. Naturaleza  Propiedades  Energía de activación  Especificidad  Clasificación  Importancia de las enzimas  Grupos prostéticos  Cofactores: coenzima, metal  Sitio activo. 

Bioquímica Médica. J.Huamán S

2

Cuestionario 

1. Qué son las enzimas?



2.¿Cuáles son las propiedades de las enzimas?



3. ¿Cuál es la importancia de las enzimas?



4. ¿Qué es un cofactor?



5.¿Qué es una coenzima?

Bioquímica Médica. J.Huamán S

3

Biomoléculas 

Agua: H y O



Proteínas:C,H,O,N



Carbohidratos:C,H,O….N



Lípidos:C,H,O,…N,P



Ácidos Nucleicos:C,H,O,P,N



Vitaminas



Intermediarios Metabolicos

ENZIMAS Polímeros biológicos que catalizan las reacciones químicas haciéndola compatible con la vida  Biocatalizadores biológicos de miles de reacciones bioquímicas: desintegración de los nutrientes para liberar energía y las unidades estructurales y luego utilizarlo para síntesis de propias macromoléculas , intercambio iónico, contracción muscular, etc. 

Bioquímica Médica. J.Huamán S

5

ENZIMAS. Propiedades.Naturaleza 

PROPIEDADES



Naturaleza: la mayoría son proteínas, excepción de las ribozimas (RNA)

Bioquímica Médica. J.Huamán S

6

Proteínas 

Macromoléculas



Unidades estructurales: aminoácidos



Unión: enlace peptídico



Péptidos: 50 aa



Proteínas >50 aa



Tamaño: variable



Forma: fibrosas y globulares



Conformación: tridimensional

Clases de AA 

Alifáticos: gli, ala,val, leu, ileu



Con grupos OH: ser, treo,tir



Con S: met, cis



Ácidos o amidas: glu, gln, asp, asn



Básicos: arg, lis, his



Aromáticos: his, phe, trp ,tir



Iminoácidos: pro

Polaridad de los AA (Baynes 2014)

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9

Bioquímica Médica. J.Huamán S

10

Estructura de las proteínas

Estructura de las proteínas (Baynes 2014)

Bioquímica Médica. J.Huamán S

12

Ribozimas

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Eficacia 

Catalizadores muy eficaces: aumentan la velocidad de reacción de 106 a 1012 respecto a la no catalizada y varias veces las catalizadas por químicos.



Ej Anhidrasa carbónica 7.7x106



AMP nucleosidasa: 6.0x1012



No se consumen ni se modifican en forma permanente

 *Harvey R, B ioquímica 5ta ed. 2011

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Anhidrasa Carbónica

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Número de recambio 



El número de recambio o kcat es el número de moléculas de sustrato convertidas en producto por molécula de enzima por segundo Suele ser 102 a 104 s-1*

 Harvey R, B ioquímica 5ta ed. 2011

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ENZIMAS. Energía de activación 

Condiciones de reacciones adecuadas a la vida: temperatura corporal, presión atmosférica, pH neutro o próximo (la mayoría).



Disminuyen la energía de activación y no alteran la constante de equilibrio

Los catalizadores químicos requieren altas temperaturas, presión elevada y pH extremo

Bioquímica Médica. J.Huamán S

17

Estado de transición 

Las enzima disminuyen la energía de activación de la reacción. La necesaria para que esta se produzca



El estado de transición representa al estado activado de los reactivos unido(s) a la enzima es decir cuando se ha alcanzado la energía de activación

Bioquímica Médica. J.Huamán S

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Energía de activación y estado de transición

Bioquímica Médica. J.Huamán S

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ENZIMAS. ESPECIFICIDAD GRAN ESPECIFICIDAD:  de su reacción : una determinada, ej. deshidrogenasa  de sus productos: no dan productos colaterales .Los c. químicos pueden actuar sobre varias reacciones, diferentes reactantes y dan productos colaterales * Murray R y col. Harper.Bioquímica ilustrada, 30 ed, 

2016

Bioquímica Médica. J.Huamán S

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Especificidad de sustrato



Uno como la glucosa en la Glucocinasa o glucosa oxidasa,



Pocos como la glucosa, manosa, fructosa en la hexocinasa .



Estereoespecificidad: Como se unen a sustratos por lo menos en tres puntos pueden distinguir estereoisómeros : D de L azúcares , L de D aminoácidos Convierten sustratos aquirales a productos quirales(con C asimétrico)*

Bioquímica Médica. J.Huamán S

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Bioquímica Médica. J.Huamán S

22

Bioquímica Médica. J.Huamán S

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ENZIMAS. Regulación 

Capacidad de regulación: de su actividad (alosterismo, modificación covalente), de su síntesis (inducción , represión) , de su degradación (aumento o disminución de su proteolisis)

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Clasificación de las enzimas (IUB) Oxidoreductasas Transferasas Hidrolasas Liasas

Isomerasas Ligasas Bioquímica Médica. J.Huamán S

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Clasificación 

Oxidoreductasas: catalizan oxidaciones y reducciones. Ejemplo: Deshidrogenasa láctica



Transferasas: transferencia de grupos funcionales. Ej: aminotransferasas, fosfotransferasas



Hidrolasas: ruptura hidrolítica de los enlaces C-C, C-O, C-N, P-O y otros como de tipo anhidrido Ej:enzimas digestivas

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Clasificación 





Liasas: ruptura de los enlaces C-C, C-O, C-N y otros enlaces mediante eliminación, dejando enlaces dobles o también adición a dobles enlaces.Ej. Citrato liasa Isomerasas: isomerización, interconversión de isómeros , cambios geométricos o estructurales en la misma molécula. Ej: Fosfohexosa isomerasa Ligasas: unión de dos moléculas acoplada a la hidrólisis de ATP o similar. Ej. DNA ligasa Bioquímica Médica. J.Huamán S

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Clases de enzimas

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Nomenclatura Antes de la IUB: diversos nombres según sustrato, tipo de reacción, etc. Pepsina, tripsina. Alcohol deshidrogenasa.  IUB:2 nombres: común y el sistemático(sustrato seguido por el tipo de reacción terminado en asa) y cuatro números: clase, subclase, subsubclase, orden de descubrimiento  Hexocinasa es ATP:D-hexosa 6 fosfotransferasa E.C.2.7.1.1. 2: transferasas 7: fosfotransferasas, 1: alcohol es el aceptor del fosforilo 

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COFACTORES ,COENZIMAS, GRUPO PROSTETICO Muchas enzimas para ser activas requieren además de la parte proteica (apoenzima) la presencia de un cofactor, y el conjunto se llama holoenzima *  Cofactor: Componente no proteico necesario para la actividad de alguna enzimas.  El cofactor puede estar libre en el medio o unido como grupo prostético  El cofactor por su naturaleza química puede ser inorgánico( generalmente un ión metálico) u orgánico ó coenzima.  Harper considera tres tipos: cofactor o ión metálico libre, coenzima y grupo prostético- que puede ser a su vez un metal o una coenzima * Lehninger, Bioquímica, 

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Cofactor

Sin cofactor

Cofactor

Unido: Grupo Prostético

Libre

Ión metálico

Bioquímica Médica. J.Huamán S

Coenzima

Ión metálico

Coenzima

31



Harper: Considera coenzimas, cofactor (metal libre) y grupo prostético (como coenzimas o metal unido a la enzima)



Baynes:metal

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Cofactores. Coenzima Molécula orgánica, ionizable.  Sirven como lanzadera de sustrato.  Transfieren hidrógeno (FAD, FMN, NAD, NADP) u otros grupos: acilo (CoA), amino (piridoxal), metilo (folato) 



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Coenzimas



Muchas enzimas requieren coenzimas:grupos 1,2,5 y 6 de IUB



Puede estar libre (difusible) o unida como grupo prostético

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Coenzimas y complejo B Vitamina

Coenzima

Nicotinamida

NAD, NADP

Riboflavina

FAD, FMN

Acido pantoténico

Coenzima A

Tiamina

Tiamina difosfato

Piridoxal (B6)

Piridoxal fosfato

Acido fólico

Varias formas

Vitamina B12

Hidroxicobalamina

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GRUPO PROSTETICO 

Grupo prostético:es una coenzima o un metal fuertemente unido a la enzima sea por enlace covalente o no covalente. Ejemplo de coenzimas como GP: fosfato de piridoxal, FMN, FAD. Los metales son los grupos prostéicos más frecuentes dando lugar a las metaloenzimas

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Coenzimas que transfieren grupos distintos al H Fosfato de azúcar CoA SH Pirofosfato de tiamina Fosfato de piridoxal Coenzimas del folato Biotina Coenzima de Cobalamida Acido lipoico Bioquímica Médica. J.Huamán S

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Coenzimas 

2. Transferencia de Hidrógeno



NAD+



NADP+



FMN



FAD



Acido lipoico



Coenzima Q

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NAD+ + 2H+ + 2e- ---NADH + H+

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FAD

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Importancia de las enzimas en el organismo humano. Importancia clínica 

Hacen posibles las reacciones bioquímicas en condiciones compatibles con la vida. Metabolismo. Anabolismo. Catabolismo



Intervienen en la homeostasis. Regulación de las vías.



Alteraciones metabólicas hereditarias o adquiridas por defectos enzimáticos. Errores innatos del metabolismo



Empleadas en el diagnóstico (ver enzimas en clínica) Aumento en algunas patologías.



Empleadas en el tratamiento.

Bioquímica Médica. J.Huamán S

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MUCHAS

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GRACIAS

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