El Yunque La cotorra puertorriqueña es verde brillante, mide cerca de 1ft, con la cabeza roja, plumas primarias en las alas color azul, y con un pico y patas color carne. Este pájaro se alimenta de futas silvestres, particularmente la palma sierra (Prestoria montana), pero también puede consumir flores y brotes tiernos. Durante Octubre cuando escasean las frutas, la fruta de tabonuco (Dacryodes excelsa) se convierte en su alimento de importancia. Actualmente solo habita en Puerto Rico, pero hasta el 1899 también se encontraba en las islas de Culebra, Vieques y la Mona. En Puerto Rico, las cotorras habitaban el bosque Guajataca hasta 1910; en el bosque Rio Abajo hasta 1920; en el bosque carite hasta 1930; en el Rio Mameyes hasta 1927. Desde 1940 su hábitat se limitaba al Yunque. Aunque el Yunque se extiende sobre 26,000 acres, las cotorras se concentraban en un área pequeña de unos 3,000 acres (Rodriguez-Vidal 1959). En la época de Colon, la población total de la cotorra excedía los 100,000 ejemplares. En el 1950, la población estimada era de 200 aves; en 1975, alcanzo una baja record de solo 13 aves. Para septiembre de 1989, antes de que el huracán Hugo impactara la isla, había unas 47 aves y 5 parejas apareadas, aunque no se apareaban anualmente. Actualmente, existen 26 libres en el bosque, incluyendo 4 parejas que se aparean, y unas 56 en cautiverio en el aviario de Luquillo.
Un coquí es una especie de rana de arboles pequeña que solamente habita en Puerto Rico. Existen 16 especies de coquíes, 13 de estas habitan en el Yunque, y 11 habitan única y exclusivamente en Puerto Rico. El coquí duende (Borrow Coqui) solamente se encuentra en el bosque enano del Yunque. Los coquíes varían en color de verde a amarillo a gris a marron. En tamaño se extienden de los 15mm, tales como el coquí duende, hasta 80mm, tal como el coquí patas de araña. Tristemente, 3 de las 16 especies en PR están en peligro de extinction.
El coquí pata de araña, el coquí palmeado, el coquí Eneida, están clasificados como en amenaza de peligro en PR. El coquí dorado es el que esta en mas peligro de los 3.