Ebola

Rastreando al Ebola

1. Considerando lo que vio en el video y lo que discutieron las Doctoras Sabeti y Moses, identifique tres factores que contribuyeron al número de individuos infectados durante el brote de Ebola. Según el video, en el brote de Ebola presentado entre 2013-2016 en la región de África Occidental se encontraron varios factores que contribuyeron al aumento de casos reportados de esta enfermedad. Entre los mas destacados se encuentran:  La falta de hospitales capacitados para lidiar con fiebres hemorrágicas como el Ebola  La alta densidad poblacional  La alta tasa de infección de los cuidadores de los pacientes 2. Defina el término “mutación”. Una mutación es un cambio en la secuencia de nucleótidos del ADN de un organismo. Estos cambios pueden representar una mejora adaptativa o una disfuncionalidad del gen mutado. 3. En sus propias palabras, ¿por qué es importante examinar las secuencias del genoma del virus del Ebola durante un brote? El principal objetivo al analizar el genoma del virus durante el brote es la prevención de mutaciones que puedan aumentar su propagación o su resistencia, haciendo la enfermedad mas difícil de tratar. Además, la secuenciación de su genoma puede servir para desarrollar medicamentos contra el virus que cubran un gran rango de cepas 4. ¿Cuál fue la fuente animal del virus que infectó posteriormente a los humanos? Según el video, el virus tiene un origen zoonótico, es decir, fue propagado de animales a humanos. Se transmitido al ser humano debido a picaduras de murciélagos ya que había contacto entre la saliva del animal y nuestro sistema circulatorio. 5. ¿En que difiere de la infección mencionada en clase con relación al virus VIH? Tanto el virus del VIH como el del ébola se transmiten por intercambio de fluidos. Sin embargo el ébola es mas transmisible que el VIH debido a que puede propagarse por contacto con cualquier fluido corporal como sangre, saliva, orina o sudor, mientas que el VIH lo hace solamente por contacto con sangre, semen, fluidos vaginales, liquido preseminal y leche materna. Ademas, el virus del ébola ataca multiples tejidos y sistemas del cuepo, mientras que en el VIH solo se atacan las celulas blancas del sistema inmune.

SECUENCIA ÉBOLA

4. Agrupe las secuencias de acuerdo a los patrones que observe. Incluya aquí una imagen de las secuencias reorganizadas según su criterio. Cada secuencia debe pertenecer a un grupo, y no es necesario que todos los miembros del mismo grupo sean idénticos. Use sus agrupaciones para responder las siguientes preguntas.  Grupo 1:



Grupo 2:

5. Qué criterios utilizó para asignar las secuencias a los distintos grupos. Podriá n existir criterios alternativos que podriá n haberse empleado. Para categorizar las secuencias de nucleotidos escogí aquellos que tuvieran TC en el primer y segundo nucleotido y en el septimo y octavo nucleotico. A esto lo llame grupo 1. Aquellos que no contaban con esta descripcion pero poseian mutaciones C en el segundo nucleotido y T en el septimo los incluí en el grupo 2 6. Si una secuencia tiene un mayor número de mutaciones en comparación con la secuencia de referencia, ¿significa que corresponde a un momento temprano o tardío del brote? Explique su respuesta Generalmente esta regla se se cumple, pues entre mas tiempo pasa mas mutaciones se van acumulando en el genoma. Sin embargo, pueden existir excepciones si una parte del brote se aislo en otro sito y contrajo mutaciones diferentes o si algunas de las mutaciones no fueron viables y desaparecieron. 7. Cree una representación gráfica que resalte la relación entre sus grupos. Los organigramas y árboles son ejemplos de representaciones gráficas efectivas. Asegúrese de que su representación incluya una flecha que indique el paso del tiempo durante el brote. Grupo 1: Secuencias 2, 5, 7, 8, 10, 12, 15

Grupo 2: Secuencias 1, 3, 4, 6, 9, 11, 13, 14

8. Compare las agrupaciones en la Figura 1 con las suyas del punto 4 (no importa si su agrupación no coincide con esta, déjela tal cual, no haga trampa!!). ¿Cuáles son las similitudes y diferencias? En mi figura hay 2 grupos, mientras que la imagen del Instituto Broad tiene 3 grupos. Su primer grupo coincide con mi segundo grupo y mi primer grupo lo dividieron en grupo 2 y 3, siendo el tercero conformados por aquellos que tengan secuencias ACC en sus últimos nucleótidos.

9. ¿Qué puede inferir de este diagrama (el del Instituto Broad) acerca del orden en que los grupos de pacientes contrajeron el Ebola? Del diagrama del Instituto Broad puedo inferir que las primeras mutaciones ocurrieron en los nucleótidos 2 y 7, luego mutaron los nucleótidos 3 y 8 y finalmente ocurrió una mutación en el último nucleótido. 10. Si una mutación en particular fuese ventajosa para el virus, permitiéndole propagarse más rápido, ¿qué esperari ́a ver con el tiempo en términos de esa mutación en las secuencias recolectadas en una població n? Si una mutación fuese ventajosa se esperaría que el resto de los desendientes tuvieran esta mutación, ya que permitiría a más organismos sobrevivir.