Efectos Aleatorios Diseño Experimental Clase 8
Factores aleatorios • Ejemplo: – Se quiere estimar el éxito reproductivo de varias especies según la población en la que se encuentren. En una población se escogen cinco especies al azar que están presentes en ambas poblaciones. – Se escogen 10 madres al azar de una población, y se cuentan el número de frutos producidos por madre.
Factores Aleatorios • Modelo usual:
• Estimar αi. Asume: εij ~N(0,σ 2 ) • Tratamientos fijos, preestablecidos
Factores aleatorio • En experimento de las especies: – Tratamientos no son pre-establecidos – Especies se escogen al azar de un grupo de posibles niveles
• Descomposición de varianza en componentes – Estimar efecto no es importante – Inferencias sobre todas las especies, no solo muestra – Nuevo experimento producirá resultados del efecto diferentes – Definir α1 en un experimento difiere de
Factores Aleatorios • Se asumen que αi es un factor aleatorio con promedio 0 y varianza: σ2a • La varianza en α y en ε, son independientes • La varianza de yij es: σ2a + σ2 • Los términos σ2a y σ2 se denominan – Componentes de variación
Factores aleatorios • Las inferencias se realizan sobre σ2 a y σ 2 • α y ε (efectos) cambiarán en el próximo experimento • Pregunta básica determina si σ2a es distinto de cero (0)
Factoriales • El modelo puede extenderse a factoriales: – Suponga que en vez de una población, se trabaja con una muestra aleatoria de dos poblaciones, de una gama de posibles poblaciones de estudio – Hay interacción especie:poblacion
Factoriales • En este caso todos los factores y las interacciones son aleatorias • Cada factor tiene su componente de varianza: yijk = µ + αi + βj + α βij +εijk – Var(αi) = σ2α – Var(Βj) = σ2β – Var(αβij) = σ2αβ 2
Factoriales • Contribución factores naturales es importante aún si interacción significativa – Estructura de correlación
• Puede haber multifactoriales
ANDEVA en Factoriales • ANDEVA se calcula de igual forma • Cuadro de ANDEVA incluye EMS – Forma de calcular componentes de variación
• Pruebas sobre componentes se construyen a partir de EMS
Tabla ANDEVA
Prueba de Hipótesis • Contrasta diferentes EMS que difieran únicamente en componente evaluado:
• El denominador de la prueba de F para un ANDEVA con factores aleatorios no siempre es MSE
FAB
MS A FA = MS AB
MS AB = MS Error
MS B FB = MS AB
Ejemplo Población 1
Población 2
Madre1
Madre 2
Madre 3
Madre 4
Madre 5
1245
1876
2654
972
1358
1635
1975
2578
889
1450
1432
1938
2656
836
1543
1526
2018
2875
905
1578
1873
1987
2153
957
1642
1684
1753
2845
918
1582
1287
2035
2666
715
1258
1385
2175
2357
868
1501
1462
1902
2498
1005
1951
1685
1967
2088
1018
1159
Tabla de ANDEVA > summary(fm1) Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F) pop 1 12387 12387 0.3136 0.5786 madre 4 14664010 3666002 92.7989 <2e-16 *** pop:madre 4 14990 3748 0.0949 0.9835 Residuals 40 1580193 39505 --Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
> replications(fruto~pop*madre, clase) pop madre pop:madre 25 10 5
Cálculo EMS ∀ σ2 = 39505 ∀ σ2madre:padre < 0 … no es posible ∀ σ2madre = 29298.03 ∀ σ2pop = 172.78 • Por estimación: – σ2madre:padre = σ2 – (σ2madre + σ2pop ) – σ2madre:padre = 10034.2
Multifactoriales
Pruebas Aproximadas • Para multifactorial, pruebas son aproximadas:
MS A + MS ABC FA = MS AB + MS AC
REML y lmer • Estimativas más correctas se realizan con funciones iterativas: – Modelos anidados – Modelos de máxima verosimilitud – No siempre son interpretables
¿por qué usar factores aleatorios? • Hacer inferencias sobre la población • Entender variación en efectos de tratamiento • Experimentos con sub-muestreo