I ESTRUCTURAS SECUNDARIA Y TERCIARIA DE LA MOLÉCULA – CONFORMACIÓN TRIDIMENSIONAL DEL ADNII.1 DINUCLEÓTIDOSLOS DINUCLEÓTIDOS SE FORMAN A TRAVÉS DE UN ENLACE FOSFODIÉSTER ENTRE DOS MONONUCLÉOTIDOS. ESTE ENLACE SE FORMA ENTRE EL GRUPO FOSFATO DE UN MONONUCLEÓTIDO (EN C5' DE SU AZÚCAR) Y EL C3' DEL AZÚCAR DEL ANTERIOR MONONUCLEÓTIDO. ASÍ, COMENZANDO CON UN GRUPO FOSFATO, TENEMOS UN AZÚCAR EN 5' (+ SU BASE) Y CUYO EXTREMO EN 3', ESTÁ UNIDO A UN SEGUNDO GRUPO FOSFATO EN 5' DE OTRO AZÚCAR, CUYO EXTREMO 3' ESTÁ LIBRE PARA UN SIGUIENTE ENLACE. LA UNIÓN – Y LA ORIENTACIÓN DE LA MOLÉCULA ES, POR TANTO 5' -> 3'.LOS POLINUCLEÓTIDOS ESTÁN FORMADOS POR LA SUCESIVA ADICIÓN DE MONÓMEROS EN UNA CONFIGURACIÓN GENERAL 5' -> 3'. EL ESQUELETO DE LA MOLÉCULA ESTÁ HECHO POR UNA SUCESIÓN DE GRUPO FOSFATO-AZÚCAR (N NUCLEÓTIDOS) – FOSFATO - AZÚCAR (NUCLEÓTIDO N+1), Y ASÍ SUCESIVAMENTE, UNIDOS COVALENTEMENTE, CON LAS BASES NITROGENADAS SITUADAS LATERALMENTE.
OBJETIVOS I ESTRUCTURAS SECUNDARIA Y TERCIARIA DE LA MOLÉCULA –CONFORMACIÓN TRIDIMENSIONAL DEL ADN
II.1 Dinucleótidos
Los dinucleótidos se forman a través de un enlace fosfodiéster entre dos mononucléotidos. Este enlace se forma entre el grupo fosfato de un mononucleótido (en C5' de su azúcar) y el C3' del azúcar del anterior mononucleótido. Así, comenzando con un grupo fosfato, tenemos un azúcar en 5' (+ su base) y cuyo extremo en 3', está unido a un segundo grupo fosfato en 5' de otro azúcar, cuyo extremo 3' está libre para un siguiente enlace. La unión – y la orientación de la molécula es, por tanto 5' -> 3'. Los polinucleótidos están formados por la sucesiva adición de monómeros en una configuración general 5' -> 3'. El esqueleto de la molécula está hecho por una sucesión de grupo fosfato-azúcar (n nucleótidos) – fosfato - azúcar (nucleótido n+1), y así sucesivamente, unidos covalentemente, con las bases nitrogenadas situadas lateralmente.
Definición y sus límites[editar] De manera menos general y precisa, se ha definido molécula como la parte más pequeña de una sustancia química que conserva sus propiedades químicas, y a partir de la cual se puede reconstituir la sustancia sin reacciones químicas. De acuerdo con esta definición, que resulta razonablemente útil para aquellas sustancias puras constituidas por moléculas, podrían existir las "moléculas monoatómicas" de gases nobles, mientras que las redes cristalinas, sales, metales y la mayoría de vidrios quedarían en una situación confusa.
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Las moléculas lábiles puede n perder su consistencia en tiempos relativamente cortos, pero si el tiempo de vida medio es del orden de unas pocas vibraciones moleculares, estamos ante un estado de transición que no se puede considerar
molécula. Actualmente, es posible el uso de láser pulsado para el estudio de la química de estos sistemas. Las entidades que comparten la definición de las moléculas pero tienen carga eléctrica se denominan iones poliatómicos, iones moleculares o moléculas ion. Las sales compuestas por iones poliatómicos se clasifican habitualmente dentro de los materiales de base molecular o materiales moleculares. Las partículas están formadas por moléculas. Una molécula viene a ser la porción de materia más pequeña que aún conserva las propiedades de la materia original.Las moléculas se encuentran fuertemente enlazadas con la finalidad de formar materia.Las moléculas están formadas por átomos unidos por medio de enlaces químicos.
Tipos de moléculas[editar] Las moléculas se pueden clasificar en:
Moléculas discretas: constituidas por un número bien definido de átomos, sean estos del mismo elemento (moléculas homonucleares, como el dinitrógeno o el fullereno) o de elementos distintos (moléculas heteronucleares, como el agua).
Los electrones de un átomo son atraídos por los protones en un núcleo atómico por la fuerza electromagnética. Los protones y los neutrones en el núcleo son atraídos el uno al otro por una fuerza diferente, la fuerza nuclear, que es generalmente más fuerte que la fuerza electromagnética que repele los protones cargados positivamente entre sí. Bajo ciertas circunstancias, más acentuado cuanto mayor número de protones tenga el átomo, la fuerza electromagnética repelente se vuelve más fuerte que la fuerza nuclear y los nucleones pueden ser expulsados o desechados del núcleo, dejando tras de sí un elemento diferente: desintegración nuclear que resulta en transmutación nuclear.
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Cada átomo se compone de un núcleo y uno o más electrones unidos al núcleo. El núcleo está compuesto de uno o más protones y típicamente un número similar de neutrones. Los protones y los neutrones son llamados nucleones. Más del 99,94 % de la masa del átomo está en el núcleo. Los protones tienen una carga eléctrica positiva, los electrones tienen una carga eléctrica negativa y los neutrones tienen ambas cargas eléctricas, haciéndolos neutros. Si el número de protones y electrones son iguales, ese átomo es eléctricamente neutro. Si un átomo tiene más o menos electrones que protones, entonces tiene una carga global negativa o positiva, respectivamente, y se denomina ion (anión si es negativa y catión si es positiva).
El número de protones en el núcleo define a qué elemento químico pertenece el átomo: por ejemplo, todos los átomos de cobre contienen 29 protones. El número de neutrones define el isótopo del elemento.5 El número de electrones influye en las propiedades magnéticas de un átomo. Los átomos pueden unirse a otro u otros átomos por enlaces químicos (en los cuales se comparten los electrones de dichos átomos) para formar compuestos químicostales como moléculas y redes cristalinas. La capacidad de los átomos de asociarse y disociarse es responsable de la mayor parte de los cambios físicos observados en la naturaleza y es el tema de la disciplina de la química. También existe la antimateria, la cual está compuesta también por átomos pero con las cargas invertidas;6 los protones tienen carga negativa y se denominan antiprotones, y los electrones tienen una carga positiva y se denominan positrones. Es muchísimo menos frecuente en la naturaleza. Al entrar en contacto con la respectiva partícula (como los protones con los antiprotones y los electrones con los positrones) ambas se aniquilan generando un estallido de energía de rayos gamma y otras partículas.
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